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Enregistrement W2170461655 · doi:10.1242/jcs.077511

ID1 and ID3 represent conserved negative regulators of human embryonic and induced pluripotent stem cell hematopoiesis

2011· article· en· W2170461655 sur OpenAlexafffund
Seok‐Ho Hong, Jong‐Hee Lee, Jung Bok Lee, Junfeng Ji, Mickie Bhatia

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyEmbryonic stem cellInduced pluripotent stem cellHaematopoiesisCell biologyHemangioblastStem cellProgenitor cellEmbryoid bodyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mechanisms that govern hematopoietic lineage specification, as opposed to the expansion of committed hematopoietic progenitors, from human pluripotent stem cells (hPSCs) have yet to be fully defined. Here, we show that within the family of genes called inhibitors of differentiation (ID), ID1 and ID3 negatively regulate the transition from lineage-specified hemogenic cells to committed hematopoietic progenitors during hematopoiesis of both human embryonic stem cells (hESCs) and human induced pluripotent stem cell (hiPSCs). Upon hematopoietic induction of hPSCs, levels of ID1 and ID3 transcripts rapidly increase, peaking at the stage of hemogenic precursor emergence, and then exclusively decrease during subsequent hematopoietic commitment. Suppression of ID1 and ID3 expression in hemogenic precursors using specific small interfering RNAs augments differentiation into committed hematopoietic progenitors, with dual suppression of ID1 and ID3 further increasing hematopoietic induction compared with upon knockdown of each gene alone. This inhibitory role of ID1 and ID3 directly affects hemogenic precursors and is not dependent on non-hemogenic cells of other lineages within developing human embryoid bodies from hESCs or hiPSCs. Our study uniquely identifies ID1 and ID3 as negative regulators of the hPSC-hematopoietic transition from a hemogenic to a committed hematopoietic fate, and demonstrates that this is conserved between hESCs and hiPSCs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,421

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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