Analysis of isolation and expression analysis of<i>ItCYP79B2</i>during rust infection of dyer's woad (<i>Isatis tinctoria</i>) by<i>Puccinia thlaspeos</i>
Notice bibliographique
Résumé
Dyer's woad (Isatis tinctoria) has been shown to have unusually high quantities of indole glucosinolates. It is known that production of glucosinolates and their hydrolysis products is part of a plant's defense response to pathogens and insects. In Arabidopsis thaliana, which, like dyer's woad, is in the family Brassicaceae, the gene sequences encoding CYP79B2 and CYP79B3 catalyze the conversion of tryptophan to indole-3-acetaldoxime during the biosynthesis of indole glucosinolates. In this study, a sequence encoding CYP79B2 was isolated from dyer's woad. ItCYP79B2 from I. tinctoria shows 97% sequence identity with CYP79B2 and 89% sequence identity with CYP79B3 from A. thaliana. Thus, it can be inferred that the I. tinctoria sequence, like that of A. thaliana, is involved in the biosynthesis of indole glucosinolates. The kinetics and amplitude of ItCYP79B2 expression during the first 72 h after infection by the pathogenic rust fungus Puccinia thlaspeos were also studied. There was a significant down-regulation of ItCYP79B2 during the first 8 h after infection of the host that coincides with fungal penetration. This was followed by induction of ItCYP79B2, coinciding with the formation of haustoria. However, after haustoria formation, ItCYP9B2 was again suppressed during the time period coinciding with successful asymptomatic systemic colonization of the host. The results of this study indicates that suppression of a gene involved in indole glucosinolate production during the penetration and post-haustorial phases of infection plays a role in pathogen establishment. They also imply that the pathogen possesses mechanisms for circumventing the elevated expression of this gene during the haustorial phase
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».