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Enregistrement W2170505111 · doi:10.1186/1745-6150-5-61

Proteomic changes associated with deletion of the Magnaporthe oryzae conidial morphology-regulating gene COM1

2010· article· en· W2170505111 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiology Direct · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesDivision of Human Resource DevelopmentNational High-tech Research and Development ProgramChina Scholarship CouncilMinistry of Education, IndiaChina Agricultural University
Mots-clésBiologyProteomeVirulenceMutantGeneMagnaportheCell biologyGeneticsMicrobiologyMagnaporthe griseaOryza sativa

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The rice blast disease caused by Magnaporthe oryzae is a major constraint on world rice production. The conidia produced by this fungal pathogen are the main source of disease dissemination. The morphology of conidia may be a critical factor in the spore dispersal and virulence of M. oryzae in the field. Deletion of a conidial morphology regulating gene encoding putative transcriptional regulator COM1 in M. oryzae resulted in aberrant conidial shape, reduced conidiation and attenuated virulence. RESULTS: In this study, a two-dimensional gel electrophoresis/matrix assisted laser desorption ionization- time of flight mass spectrometry (2-DE/MALDI-TOF MS) based proteomics approach was employed to identify the cellular and molecular components regulated by the COM1 protein (COM1p) that might contribute to the aberrant phenotypes in M. oryzae. By comparing the conidial proteomes of COM1 deletion mutant and its isogenic wild-type strain P131, we identified a potpourri of 31 proteins that exhibited statistically significant alterations in their abundance levels. Of these differentially regulated proteins, the abundance levels of nine proteins were elevated and twelve were reduced in the Δcom1 mutant. Three proteins were detected only in the Δcom1 conidial proteome, whereas seven proteins were apparently undetectable. The data obtained in the study suggest that the COM1p plays a key role in transcriptional reprogramming of genes implicated in melanin biosynthesis, carbon and energy metabolism, structural organization of cell, lipid metabolism, amino acid metabolism, etc. Semi-quantitative RT-PCR analysis revealed the down-regulation of genes encoding enzymes involved in melanin biosynthesis in the COM1 mutant. CONCLUSIONS: Our results suggest that the COM1p may regulate the transcription of genes involved in various cellular processes indispensable for conidial development and appressorial penetration. These functions are likely to contribute to the effects of COM1p upon the aberrant phenotypes of M. oryzae.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,330

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle