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Enregistrement W2170520502 · doi:10.1080/15287390903421235

Use of a (Quantitative) Structure–Activity Relationship [(Q)Sar] Model to Predict the Toxicity of Naphthenic Acids

2009· article· en· W2170520502 sur OpenAlexaffabout
Richard Frank, Hans Sanderson, Richard Kavanagh, B. Kent Burnison, John V. Headley, Keith R. Solomon

Notice bibliographique

RevueJournal of Toxicology and Environmental Health · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiquePetroleum Processing and Analysis
Établissements canadiensUniversity of GuelphEnvironment and Climate Change CanadaUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDaphnia magnaNaphthenic acidToxicityChemistryAcute toxicityEnvironmental chemistryExtraction (chemistry)ChromatographyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Naphthenic acids (NA) are a complex mixture of carboxylic acids that are natural constituents of oil sand found in north-eastern Alberta, Canada. NA are released and concentrated in the alkaline water used in the extraction of bitumen from oil sand sediment. NA have been identified as the principal toxic components of oil sands process-affected water (OSPW), and microbial degradation of lower molecular weight (MW) NA decreases the toxicity of NA mixtures in OSPW. Analysis by proton nuclear magnetic resonance spectroscopy indicated that larger, more cyclic NA contain greater carboxylic acid content, thereby decreasing their hydrophobicity and acute toxicity in comparison to lower MW NA. The relationship between the acute toxicity of NA and hydrophobicity suggests that narcosis is the probable mode of acute toxic action. The applicability of a (quantitative) structure-activity relationship [(Q)SAR] model to accurately predict the toxicity of NA-like surrogates was investigated. The U.S. Environmental Protection Agency (EPA) ECOSAR model predicted the toxicity of NA-like surrogates with acceptable accuracy in comparison to observed toxicity values from Vibrio fischeri and Daphnia magna assays, indicating that the model has potential to serve as a prioritization tool for identifying NA structures likely to produce an increased toxicity. Investigating NA of equal MW, the ECOSAR model predicted increased toxic potency for NA containing fewer carbon rings. Furthermore, NA structures with a linear grouping of carbon rings had a greater predicted toxic potency than structures containing carbon rings in a clustered grouping.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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