MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2170609256 · doi:10.18632/oncotarget.1558

Common reduction of the Raf kinase inhibitory protein in clear cell renal cell carcinoma

2014· article· en· W2170609256 sur OpenAlexafffundabout
Brianne Hill, Jason De Melo, Judy Yan, Anil Kapoor, Lizhi He, Jean‐Claude Cutz, Xingchang Feng, Nazihah Bakhtyar, Damu Tang

Notice bibliographique

RevueOncotarget · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal cell carcinoma treatment
Établissements canadiensSt. Joseph’s Healthcare HamiltonSt. Joseph's HospitalMcMaster University
Organismes subventionnairesKidney Foundation of Canada
Mots-clésClear cell renal cell carcinomaMedicineCarcinogenesisRenal cell carcinomaInternal medicineCancer researchOncologyCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

// Brianne Hill 1 , 2 , 3 , Jason De Melo 1 , 2 , 3 , Judy Yan 1 , 2 , 3 , Anil Kapoor 3 , 4 , Lizhi He 1 , 2 , 3 , 5 , Jean-Claude Cutz 6 , Xingchang Feng 1 , 3 , 7 , Nazihah Bakhtyar 1 , 2 , 3 , Damu Tang 1 , 2 , 3 1 Division of Nephrology, Department of Medicine, McMaster University, Hamilton, Ontario, Canada, Hamilton, Ontario, Canada 2 Father Sean O’Sullivan Research Institute, Hamilton, Ontario, Canada 3 The Hamilton Center for Kidney Research, St. Joseph’s Hospital, Hamilton, Ontario, Canada 4 Division of Urology, Department of Surgery, McMaster University, Hamilton, Ontario, Canada 5 Department of Biological Chemistry and Molecular Pharmacology (BCMP), Harvard Medical School, Boston, MA, USA 6 Department of Pathology, McMaster University, Hamilton, Ontario, Canada. 7 College of Veterinary Medicine, Northeast Agricultural University, Harbin, China 150030 Correspondence: Damu Tang e-mail: damut@mcmaster.ca Running title: RKIP suppresses ccRCC tumorigenesis Key words: RKIP, Raf, ERK, ccRCC, and kidney cancer Received: October 30, 2013      Accepted: April 21, 2014      Published: April 24, 2014 ABSTRACT Despite the recent progress in our understanding of clear cell renal cell carcinomas (ccRCCs), the etiology of ccRCC remains unclear. We reported here a prevailing reduction of the raf kinase inhibitory protein (RKIP) in ccRCC. In our examination of more than 600 ccRCC patients by western blot and immunohistochemistry, RKIP was significantly reduced in 80% of tumors. Inhibition of RKIP transcription in ccRCC occurs to greater levels than VHL transcription based on the quantification analysis of their transcripts in six large datasets of DNA microarray available in Oncomine™ with the median rank of suppression being 582 and 2343 for RKIP and VHL, respectively. Collectively, the magnitude of RKIP reduction and the levels of its downregulation match those of VHL. Furthermore, RKIP displays tumor suppressing activity in ccRCC. While modulation of RKIP expression did not affect the proliferation of A498 and 786-0 ccRCC cells and neither their ability to form xenograft tumors in NOD/SCID mice, ectopic expression or knockdown of RKIP inhibited or enhanced A498 and 786-0 ccRCC cell invasion, respectively. This was associated with robust changes in vimentin expression, a marker of EMT. Taken together, we demonstrate here that downregulation of RKIP occurs frequently at a rate that reaches that of VHL, suggesting RKIP being a critical tumor suppressor for ccRCC. This is consistent with RKIP being a tumor suppressor for other cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,066
Score d'incertitude au seuil0,543

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2014
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueOncotargetMême sujetRenal cell carcinoma treatmentTravaux en français237 207