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Enregistrement W2170648533 · doi:10.1111/jeu.12208

Molecular Phylogeny of Mobilid and Sessilid Ciliates Symbiotic in Eastern Pacific Limpets (Mollusca: Patellogastropoda)

2015· article· en· W2170648533 sur OpenAlexafffund
Nicholas A. T. Irwin, Denis H. Lynn

Notice bibliographique

RevueJournal of Eukaryotic Microbiology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtist diversity and phylogeny
Établissements canadiensUniversity of GuelphUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesFisheries and Oceans Canada
Mots-clésBiologyMonophylyCladeMolecular phylogeneticsZoologyPhylogenetic treeBiogeographyEvolutionary biologySister groupEcologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The phylogenetic relationships of the ciliate subclass Peritrichia, composed of the orders Mobilida and Sessilida, have recently come under debate as morphological and molecular analyses have struck contrasting conclusions as to the monophyly of the group. We provide additional molecular data to assess the monophyly of the Peritrichia by sequencing the small subunit ribosomal RNA genes of two symbiotic peritrichs, Urceolaria korschelti and Scyphidia ubiquita, found inhabiting the mantle cavity of limpets. Although phylogenetic analyses indicated a nonmonophyletic Peritrichia, approximately unbiased tests revealed that the monophyletic hypothesis could not be rejected. With regard to the Mobilida, our analysis showed divergence within the family Trichodinidae related to host taxa-a molluscan clade and a fish clade. For the Sessilida, the family Scyphidiidae was sister to the Astylozoidae. In our sampling of U. korschelti and S. ubiquita, both species showed significant genetic divergence among geographically isolated, yet morphologically indistinguishable populations. We hypothesize that cryptic speciation has produced these morphologically identical species and argue that more extensive genomic analyses are required to fully assess the monophyly, biogeography, and ultimately biodiversity of the peritrichs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,122
Score d'incertitude au seuil0,711

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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