MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2170814332 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-05-1810

Neosquamous Epithelium Does Not Typically Arise from Barrett's Epithelium

2006· article· en· W2170814332 sur OpenAlexaff
Thomas G. Paulson, Lianjun Xu, Carissa A. Sanchez, Patricia L. Blount, Kamran Ayub, Robert D. Odze, Brian J. Reid

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEsophageal Cancer Research and Treatment
Établissements canadiensImmunovaccine (Canada)
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésEpitheliumMicrodissectionBiologyBarrett's esophagusProgenitor cellPathologyIntestinal epitheliumEsophagusCDX2DysplasiaRespiratory epitheliumCDKN2AStem cellAdenocarcinomaMedicineCancerAnatomyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Neosquamous epithelium (NSE) can arise within Barrett's esophagus as a consequence of medical or surgical acid reduction therapy, as well as after endoscopic ablation. Morphologic studies have suggested that NSE can develop from adjacent squamous epithelium, submucosal gland ducts, or multipotent progenitor cell(s) that can give rise to either squamous or Barrett's epithelium, depending on the luminal environment. The cells responsible for Barrett's epithelium self-renewal are frequently mutated during neoplastic progression. If NSE arises from the same cells that self-renew the Barrett's epithelium, the two tissues should be clonally related and share genetic alterations; if NSE does not originate in the self-renewing Barrett's, NSE and Barrett's esophagus should be genetically independent. EXPERIMENTAL DESIGN: We isolated islands of NSE and the surrounding Barrett's epithelium from 20 patients by microdissection and evaluated each tissue for genetic alterations in exon 2 of CDKN2A or exons 5 to 9 of the TP53 gene. Nine patients had p16 mutations and 11 had TP53 mutations within the Barrett's epithelium. RESULTS: In 1 of 20 patients, a focus of NSE had a 146 bp deletion in p16 identical to that found in surrounding Barrett's epithelium. The NSE in the remaining 19 patients was wild-type for p16 or TP53. CONCLUSION: Our mutational data support the hypothesis that, in most circumstances, NSE originates in cells different from those responsible for self-renewal of Barrett's epithelium. However, in one case, NSE and Barrett's epithelium seem to have arisen from a progenitor cell that was capable of differentiating into either intestinal metaplasia or NSE.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,114
Tête enseignante GPT0,478
Écart entre enseignants0,364 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueClinical Cancer ResearchMême sujetEsophageal Cancer Research and TreatmentTravaux en français237 207