Regulation of iron–sulphur cluster homeostasis through transcriptional control of the <scp>Isc</scp> pathway by [2<scp>Fe</scp>–2<scp>S</scp>]–<scp>IscR</scp> in <i><scp>E</scp>scherichia coli</i>
Notice bibliographique
Résumé
Fe-S clusters are essential across the biological world, yet how cells regulate expression of Fe-S cluster biogenesis pathways to cope with changes in Fe-S cluster demand is not well understood. Here, we describe the mechanism by which IscR, a [2Fe-2S] cluster-containing regulator of Escherichia coli, adjusts the synthesis of the Isc Fe-S biogenesis pathway to maintain Fe-S homeostasis. Our data indicate that a negative feedback loop operates to repress transcription of the iscRSUA-hscBA-fdx operon, encoding IscR and the Isc machinery, through binding of [2Fe-2S]-IscR to two upstream binding sites. IscR was shown to require primarily the Isc pathway for synthesis of its Fe-S cluster, providing a link between IscR activity and demands for Fe-S clusters through the levels of the Isc system. Surprisingly, the isc operon was more repressed under anaerobic conditions, indicating increased Fe-S cluster occupancy of IscR and decreased Fe-S cluster biogenesis demand relative to aerobic conditions. Consistent with this notion, overexpression of a Fe-S protein under aerobic conditions, but not under anaerobic conditions, led to derepression of P(iscR). Together, these data show how transcriptional control of iscRSUA-hscBA-fdx by [2Fe-2S]-IscR allows E. coli to respond efficiently to varying Fe-S demands.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».