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Enregistrement W2170858747 · doi:10.1080/08958370902962309

Impact of nose-only exposure system on pulmonary gene expression

2009· article· en· W2170858747 sur OpenAlexaff
Errol M. Thomson, Andrew Williams, Carole L. Yauk, Renaud Vincent

Notice bibliographique

RevueInhalation Toxicology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAir Quality and Health Impacts
Établissements canadiensHealth Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlucocorticoid receptorProinflammatory cytokineGene expressionBiologyNoseMicroarrayGeneReal-time polymerase chain reactionChemokineGlucocorticoidInflammationMicroarray analysis techniquesImmunologyMolecular biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nose-only exposure is used to study the distribution and toxicity of airborne contaminants. Restraint of animals in nose-only tubes causes stress, but the impact on pulmonary mRNA levels is unknown. Since stress and xenobiotics activate common pathways, we assessed whether nose-only exposure would alter expression of toxicologically relevant genes in the lungs. To identify candidate genes for further analysis, we first interrogated microarray data to examine time-dependent changes in gene expression in air-control animals from a nose-only inhalation study involving male wild-type C57BL/6 mice and transgenic tumor necrosis factor (TNF)-alpha over-expressing littermates. Comparison of transcript levels immediately and 24 h after a single 4-h nose-only exposure to air revealed differential expression of 280 genes (false discovery rate-adjusted, p < .05). Functional analysis revealed enrichment of immune response, apoptosis, and signalling terms, consistent with effects of restraint stress. We then selected a subset of target genes for comparison of naive animals and air-exposed animals from the inhalation study by real-time polymerase chain reaction (PCR). Expression of genes involved in stress (BNIP, sestrin-1, CDKN1A [p21], GADD45 gamma), glucocorticoid-response (GILZ, Sgk), and signal transduction (MAP3K6, C/EBP-delta) was increased as a result of nose-only exposure (p < .05). In contrast, proinflammatory factors (lymphotoxin-beta, chemokine receptor CXCR5) were decreased (p < .05). Immune gene responses observed in wild-type animals were reduced in animals with lung inflammation, indicating that pathological states can modify the response to nose-only exposure. Observed responses may warrant consideration in the evaluation of materials delivered by nose-only inhalation, and suggest that incorporation of naive animals into nose-only studies should be considered as a best practice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,697
Score d'incertitude au seuil0,836

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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