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Enregistrement W2170900663 · doi:10.1095/biolreprod.107.063057

Establishment of a Short-Term In Vitro Assay for Mouse Spermatogonial Stem Cells1

2007· article· en· W2170900663 sur OpenAlexaff
Jonathan R. Yeh, Xiangfan Zhang, Makoto Nagano

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSperm and Testicular Function
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Science Council
Mots-clésBiologyTransplantationIn vitroCluster (spacecraft)Stem cellCell biologyComputational biologyImmunologyAndrologyGeneticsComputer scienceInternal medicineMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Spermatogonial stem cells (SSCs) are responsible for life-long, daily production of male gametes and for the transmission of genetic information to the next generation. Unequivocal detection of SSCs has relied on spermatogonial transplantation, in which functional SSCs are analyzed qualitatively and quantitatively based on their regenerative capacity. However, this technique has some significant limitations. For example, it is a time-consuming procedure, as data acquisition requires at least 8 weeks after transplantation. It is also laborious, requiring microinjection of target cells into the seminiferous tubules of individual testes. Donor-recipient immunocompatibility for successful transplantation and large variations in data obtained represent further limitations of this technique. In the present study, we provide evidence that a recently developed SSC culture system can be employed as a reliable, short-term in vitro assay for SSCs. In this system, donor cells generate three-dimensional structures of aggregated germ cells (clusters) in vitro within 6 days. We show that each cluster originates from a single cell. Thus, by counting the clusters, cluster-forming cells can be quantified. We observed a strong linear correlation between the numbers of clusters and SSCs over extended culture periods. Therefore, cluster numbers faithfully reflect SSC numbers. These results indicate that by simply counting the number of clusters, functional SSCs can be readily detected within 1 week in a semi-quantitative manner. The faithfulness of this in vitro assay to the transplantation assay was further confirmed under two experimental situations. This in vitro cluster formation assay provides a reliable short-term technique to detect SSCs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations76
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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