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Enregistrement W2170912757 · doi:10.1128/jb.183.12.3537-3547.2001

The LuxM Homologue VanM from <i>Vibrio anguillarum</i> Directs the Synthesis of <i>N</i> -(3-Hydroxyhexanoyl)homoserine Lactone and <i>N</i> -Hexanoylhomoserine Lactone

2001· article· en· W2170912757 sur OpenAlexfundno aff
Debra L. Milton, Victoria J. Chalker, David Kirke, Andrea Hardman, Miguel Cámara, Paul Williams

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesResearch Nova ScotiaVetenskapsrådetBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilSkogs- och Jordbrukets Forskningsråd
Mots-clésHomoserineQuorum sensingVibrio harveyiBiologyLactoneVibrio anguillarumAutoinducerMicrobiologyBiochemistryVibrioGeneVirulenceBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vibrio anguillarum, which causes terminal hemorrhagic septicemia in fish, was previously shown to possess a LuxRI-type quorum-sensing system (vanRI) and to produce N-(3-oxodecanoyl)homoserine lactone (3-oxo-C10-HSL). However, a vanI null mutant still activated N-acylhomoserine lactone (AHL) biosensors, indicating the presence of an additional quorum-sensing circuit in V. anguillarum. In this study, we have characterized this second system. Using high-pressure liquid chromatography in conjunction with mass spectrometry and chemical analysis, we identified two additional AHLs as N-hexanoylhomoserine lactone (C6-HSL) and N-(3-hydroxyhexanoyl)homoserine lactone (3-hydroxy-C6-HSL). Quantification of each AHL present in stationary-phase V. anguillarum spent culture supernatants indicated that 3-oxo-C10-HSL, 3-hydroxy-C6-HSL, and C6-HSL are present at approximately 8.5, 9.5, and 0.3 nM, respectively. Furthermore, vanM, the gene responsible for the synthesis of these AHLs, was characterized and shown to be homologous to the luxL and luxM genes, which are required for the production of N-(3-hydroxybutanoyl)homoserine lactone in Vibrio harveyi. However, resequencing of the V. harveyi luxL/luxM junction revealed a sequencing error present in the published sequence, which when corrected resulted in a single open reading frame (termed luxM). Downstream of vanM, we identified a homologue of luxN (vanN) that encodes a hybrid sensor kinase which forms part of a phosphorelay cascade involved in the regulation of bioluminescence in V. harveyi. A mutation in vanM abolished the production of C6-HSL and 3-hydroxy-C6-HSL. In addition, production of 3-oxo-C10-HSL was abolished in the vanM mutant, suggesting that 3-hydroxy-C6-HSL and C6-HSL regulate the production of 3-oxo-C10-HSL via vanRI. However, a vanN mutant displayed a wild-type AHL profile. Neither mutation affected either the production of proteases or virulence in a fish infection model. These data indicate that V. anguillarum possesses a hierarchical quorum sensing system consisting of regulatory elements homologous to those found in both V. fischeri (the LuxRI homologues VanRI) and V. harveyi (the LuxMN homologues, VanMN).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,489
Score d'incertitude au seuil0,857

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations127
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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