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Enregistrement W2170947836

Predictors of clustering of tuberculosis in Greater Vancouver: a molecular epidemiologic study.

2002· article· en· W2170947836 sur OpenAlexaffabout
Eduardo Hernández‐Garduño, Dennis Kunimoto, Lei Wang, Mabel Rodrigues, R. Kevin Elwood, W. A. P. Black, Sunny Mak, J. Mark FitzGerald

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of AlbertaBC Centre for Disease Control
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTuberculosisOdds ratioMedicineConfidence intervalMycobacterium tuberculosisLogistic regressionRestriction fragment length polymorphismCluster (spacecraft)Internal medicineEpidemiologyDNA profilingDemographyMolecular epidemiologyGenotypeBiologyGeneticsPathologyDNA
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The understanding of how tuberculosis is transmitted can be improved by combining DNA fingerprinting of Mycobacterium tuberculosis with conventional epidemiologic methods. We used such techniques to determine the predictors of clustering of identical isolates from tuberculosis patients in Vancouver. METHODS: We used the restriction fragment length polymorphism (RFLP) technique and, if necessary, spoligotyping to determine DNA patterns of M. tuberculosis isolates from all patients with newly diagnosed tuberculosis in Greater Vancouver reported to the Division of Tuberculosis Control from January 1995 to March 1999. Isolates were considered to be part of a cluster if they had an identical DNA pattern. We also collected demographic and epidemiologic data. Predictors associated with being in a cluster were analyzed in a multivariate logistic regression model. RESULTS: Isolates from 793 patients (430 men) were identified; 137 (17.3%) were considered to be in clusters. After adjustment for multiple potential predictors, we found that the following patients were more likely to be part of a cluster: Canadian-born Aboriginals (v. foreign-born patients) (adjusted odds ratio [OR] 6.0, 95% confidence interval [CI] 3.0-11.7), Canadian-born non-Aboriginals (v. foreign-born patients) (adjusted OR 3.6, 95% CI 2.1-6.3), and injection drug users (v. patients who did not inject drugs) (adjusted OR 3.9, 95% CI 1.9-8.1). Patients with a prior history of tuberculosis were less likely to be part of a cluster than were patients with no history of tuberculosis (adjusted OR 0.3, 95% CI 0.1-0.8). INTERPRETATION: Our findings indicate the need to target groups at high risk of tuberculosis more aggressively to prevent transmission and to treat latent infection. DNA fingerprinting may be a useful adjunct to conventional epidemiologic methods to monitor the transmission of tuberculosis in an inner-city setting.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,482

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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