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Enregistrement W2171077289 · doi:10.1665/034.020.0205

Subfamilies Acridinae, Gomphocerinae and Oedipodinae are “Fuzzy Sets”: A Proposal for a Common African Origin

2011· article· en· W2171077289 sur OpenAlexaff
W. Chapco, Daniel Contreras

Notice bibliographique

RevueJournal of Orthoptera Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueOrthoptera Research and Taxonomy
Établissements canadiensUniversity of Regina
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMonophylyParaphylyMaximum parsimonyPhylogenetic treeSister groupTaxonEvolutionary biologyZoologyCladeEcologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We propose that subfamilies Acridinae (including Truxalinae), Gomphocerinae and Oedipodinae are not monophyletic, and that, as a collective, originated in Africa some time before 100 mya.Our conclusions are based on a phylogenetic analysis of portions of 5 mitochondrial genes, totalling up to about 2.7 kilobase pairs, in 117 species collected in the Americas, Eurasia, Africa and Australia. Sequences were analyzed by weighted and unweighted maximum parsimony, maximum likelihood and Bayesian methods. Pyrgomorpha conica served as the outgroup. Biogeographic origins and patterns were inferred by applying the programs “DIVA” and “r8s”, for spatial and temporal analyses, respectively.Maximum sorting of taxa using parsimony was achieved by assigning differential weights to the three codon positions. Resolution was, however, generally poor. Bayesian methods, by contrast, yielded a topology which was virtually identical to the maximum likelihood tree and, for the most part, fully resolved and interpretable. We provide arguments in support of favoring the use of the Bayesian tree to infer relationships and biogeographic origins.Neither subfamily, as defined in the current on-line Orthoptera Species File 2, proved to be monophyletic. Instead, taxa assorted themselves into 3 broad categories: 1) Gomphocerinae, plus a small subset of acridines; 2) a sister group consisting of Oedipodinae, plus another small subset of acridines; and basal and paraphyletic to this pair, 3) the remaining taxa, all African and primarily members of the Acridinae. Very few tribes within these subfamilies proved to be monophyletic.This phylogenetic pattern is reflected biogeographically and points to a common African origin for the subfamilies. The following migrations, initially those of (most likely) proto-acridines, are further suggested by the data: 1) movement from Africa to South America establishing genera of that continent's Gomphocerinae (e.g., Jagomphocerus) and Acridinae (e.g., Metaleptea), followed by incursions into North America, leading to species such as Amblytropidia mysteca; 2) a somewhat circuitous sequence of events involving a reverse migration from South America to Africa (establishing genera such as Thyridota) with ensuing dispersals to Eurasia (forming genera such as Myrmeleotettix) and to North America (leading to, for example, Brunneria and the bulk of that continent's Gomphocerinae); 3) almost simultaneous with the first event, migration of other early acridines from Africa to Eurasia, establishing the latter continent's Oedipodinae (e.g., Angaracris). Subsequent dispersals to North America and the South Pacific led to genera such as Camnula and Austroicetes, respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,173
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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