Molecular phylogeny of the <scp>N</scp>ew <scp>W</scp>orld gecko genus <i><scp>H</scp>omonota</i> (<scp>S</scp>quamata: <scp>P</scp>hyllodactylidae)
Notice bibliographique
Résumé
The genus Homonota was described by Gray (1845) and currently includes 10 species: Homonota andicola , H. borellii , H. darwinii , H. fasciata , H. rupicola , H. taragui , H. underwoodi , H. uruguayensis , H. williamsii & H. whitii and one subspecies of H. darwinii ( H. darwinii macrocephala ). It is distributed from 15° latitude south in southern Brazil, through much of Bolivia, Paraguay, Uruguay and Argentina to 54° south in Patagonia and across multiple different habitats. Several morphological taxonomic studies on a subset of these species have been published, but no molecular phylogenetic hypotheses are available for the genus. The objective of this study is to present a molecular phylogenetic hypothesis for all the described species in the genus. We sequenced two mitochondrial genes (cyt‐ b & 12S: 1745 bp), seven nuclear protein coding ( RBMX , DMLX , NKTR , PLRL , SINCAIP , MXRA 5, ACA 4: 5804 bp) and two anonymous nuclear loci (30Hb, 19Hb: 1306 bp) and implemented traditional concatenated analyses ( MP , ML , BI ) as well as species‐tree (* beast ) approaches. All methods recovered almost the same topology. We recovered the genus Homonota as monophyletic with strong statistical support. Within Homonota, there are three strongly supported clades ( whitii , borellii and fasciata ), which differ from those previously proposed based on scale shape, osteology, myology and quantitative characters. Detailed morphological analyses based on this highly resolved and well‐supported phylogeny will provide a framework for understanding morphological evolution and historical biogeography of this phenotypically conservative genus. We hypothesize that extensive marine transgressions during Middle and Late Miocene most probably isolated the ancestors of the three main clades in eastern Uruguay ( borellii group), north‐western Argentina‐southern Bolivia ( fasciata group), and central‐western Argentina ( whitii group). Phylogeographic and morphological/morphometric analyses coupled with paleo‐niche modelling are needed to better understand its biogeographical history.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».