Inhibition of Chk1 by the G2 DNA damage checkpoint inhibitor isogranulatimide
Notice bibliographique
Résumé
Inhibitors of the G(2) DNA damage checkpoint can selectively sensitize cancer cells with mutated p53 to killing by DNA-damaging agents. Isogranulatimide is a G(2) checkpoint inhibitor containing a unique indole/maleimide/imidazole skeleton identified in a phenotypic cell-based screen; however, the mechanism of action of isogranulatimide is unknown. Using natural and synthetic isogranulatimide analogues, we show that the imide nitrogen and a basic nitrogen at position 14 or 15 in the imidazole ring are important for checkpoint inhibition. Isogranulatimide shows structural resemblance to the aglycon of UCN-01, a potent bisindolemaleimide inhibitor of protein kinase C beta (IC(50), 0.001 micromol/L) and of the checkpoint kinase Chk1 (IC(50), 0.007 micromol/L). In vitro kinase assays show that isogranulatimide inhibits Chk1 (IC(50), 0.1 micromol/L) but not protein kinase C beta. Of 13 additional protein kinases tested, isogranulatimide significantly inhibits only glycogen synthase kinase-3beta (IC(50), 0.5 micromol/L). We determined the crystal structure of the Chk1 catalytic domain complexed with isogranulatimide. Like UCN-01, isogranulatimide binds in the ATP-binding pocket of Chk1 and hydrogen bonds with the backbone carbonyl oxygen of Glu(85) and the amide nitrogen of Cys(87). Unlike UCN-01, the basic N15 of isogranulatimide interacts with Glu(17), causing a conformation change in the kinase glycine-rich loop that may contribute importantly to inhibition. The mechanism by which isogranulatimide inhibits Chk1 and its favorable kinase selectivity profile make it a promising candidate for modulating checkpoint responses in tumors for therapeutic benefit.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».