Ammonia excretion in<i>Caenorhabditis elegans</i>: mechanism and evidence of ammonia transport of the Rhesus protein CeRhr-1
Notice bibliographique
Résumé
The soil-dwelling nematode Caenorhabditis elegans is a bacteriovorous animal, excreting the vast majority of its nitrogenous waste as ammonia (25.3±1.2 µmol gFW(-1) day(-1)) and very little urea (0.21±0.004 µmol gFW(-1) day(-1)). Although these roundworms have been used for decades as genetic model systems, very little is known about their strategy to eliminate the toxic waste product ammonia from their bodies into the environment. The current study provides evidence that ammonia is at least partially excreted via the hypodermis. Starvation reduced the ammonia excretion rates by more than half, whereas mRNA expression levels of the Rhesus protein CeRhr-2, V-type H(+)-ATPase (subunit A) and Na(+)/K(+)-ATPase (α-subunit) decreased correspondingly. Moreover, ammonia excretion rates were enhanced in media buffered to pH 5 and decreased at pH 9.5. Inhibitor experiments, combined with enzyme activity measurements and mRNA expression analyses, further suggested that the excretion mechanism involves the participation of the V-type H(+)-ATPase, carbonic anhydrase, Na(+)/K(+)-ATPase, and a functional microtubule network. These findings indicate that ammonia is excreted, not only by apical ammonia trapping, but also via vesicular transport and exocytosis. Exposure to 1 mmol l(-1) NH4Cl caused a 10-fold increase in body ammonia and a tripling of ammonia excretion rates. Gene expression levels of CeRhr-1 and CeRhr-2, V-ATPase and Na(+)/K(+)-ATPase also increased significantly in response to 1 mmol l(-1) NH4Cl. Importantly, a functional expression analysis showed, for the first time, ammonia transport capabilities for CeRhr-1 in a phylogenetically ancient invertebrate system, identifying these proteins as potential functional precursors to the vertebrate ammonia-transporting Rh-glycoproteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».