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Enregistrement W2171327263 · doi:10.1677/jme.0.0250243

Quantification of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) estrogen receptor-alpha messenger RNA and its expression in the ovary during the reproductive cycle

2000· article· en· W2171327263 sur OpenAlexaff
JJ Nagler, Michelle Krisfalusi, DG Cyr

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Endocrinology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReproductive biology and impacts on aquatic species
Établissements canadiensArmand Frappier MuseumInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesOffice of Experimental Program to Stimulate Competitive ResearchNational Center for Research ResourcesNational Science Foundation
Mots-clésBiologyMessenger RNAMolecular biologyEstrogen receptorVitellogenesisEstrogen receptor alphaRainbow troutRNAComplementary DNAGene expressionOvaryReal-time polymerase chain reactionEstrogenGeneEmbryoEndocrinologyOocyteCell biologyGeneticsFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study developed a quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) method to measure estrogen receptor-alpha (ERalpha) mRNA in the rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). Using RT-PCR, and primers based on the known ERalpha DNA sequence in this species, cDNA sequences representing most of the protein coding region were obtained from ovary poly A(+) RNA. Using these DNA sequences as probes in Northern blot hybridizations confirmed that a single transcript of 4.2 kilobases in poly A(+) RNA could be detected in liver and ovary RNA. For the quantitative RT-PCR assay an internal standard RNA molecule was produced to control for inherent inter-tube differences in amplification efficiency and permit accurate quantification of ERalpha mRNAs. The quantitative RT-PCR assay proved to be highly specific for ERalpha mRNA with a detection limit of 6.9 fg, which corresponds to 273 fg ERalpha mRNA/microg total RNA. The quantitative RT-PCR assay was used to measure the levels of ERalpha mRNA in ovaries of rainbow trout at different stages of reproductive development. Ovarian ERalpha mRNA expression was found during two distinct periods of reproductive development, in pre-vitellogenic ovaries of fish with ovarian follicle diameters (OFDs) </=100 microm and in mid-vitellogenic ovaries with OFDs >1000 microm. ERalpha mRNA could not be detected in the ovaries of fish with OFDs >100 microm but </=1000 microm. The highest levels of ERalpha mRNA were found in late vitellogenic ovaries of fish with OFDs >2000 microm.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,368

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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