The expression pattern of the ITIM-bearing lectin CLECSF6 in neutrophils suggests a key role in the control of inflammation
Notice bibliographique
Résumé
In our study of the modulation of the expression of inflammation-related genes in neutrophils, we have found a gene called CLECSF6 (C-type lectin superfamily 6). CLECSF6 expresses two mRNA species at low levels in resting neutrophils. Here, we describe for the first time the sequence of the short mRNA version. It lacks amino acids that are likely to affect the functionality of its protein product. GM-CSF, IL-3, IL-4, and IL-13 caused an accumulation of the short CLECSF6 mRNA in neutrophils. The surface expression of the CLECSF6 protein was reduced by TNF-alpha, IL-1alpha, LPS, and Matrigel. CLECSF6 bears the immunoreceptor tyrosine-based inhibition motif (ITIM) involved in signal transduction resulting in the inhibition of leukocyte activation. We propose that some neutrophil activators modulate the expression of CLECSF6 at the mRNA (GM-CSF, IL-3, IL-4, and IL-13) or protein (TNF-alpha, IL-1alpha, LPS, and Matrigel) levels in ways that block ITIM-based transduction of anti-inflammatory signals and therefore promote inflammation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».