MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2171342112 · doi:10.1093/cvr/cvn357

Egr-1 negatively regulates calsequestrin expression and calcium dynamics in ventricular cells

2008· article· en· W2171342112 sur OpenAlexaff
Amanda Kasneci, Naomi M. Kemeny-Suss, Svetlana V. Komarova, Lorraine E. Chalifour

Notice bibliographique

RevueCardiovascular Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSignaling Pathways in Disease
Établissements canadiensJewish General HospitalMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCalsequestrinPhospholambanBiologyChromatin immunoprecipitationMolecular biologyCalreticulinImmunoprecipitationCell biologyCalcium-binding proteinEndoplasmic reticulumRyanodine receptorGene expressionCalciumChemistryPromoterBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: The transcription factor early growth response-1 (Egr-1) is increased in models of cardiac pathology; however, it is unclear how Egr-1 impacts the heart. We sought to identify how Egr-1 regulates expression of proteins involved in cardiomyocyte calcium homeostasis. METHODS: Protein expression was measured by immunoblotting in control cardiac differentiated H9c2 cells or in H9c2 cells overexpressing wild-type Egr-1 (Egr-1) or an Egr-1 (I293F) mutant. Microspectrofluorimetry of fura-2-loaded cells was used to study calcium dynamics. Chromatin immunoprecipitation with anti-Egr-1 antibody was used to identify Egr-1-associated DNA. RESULTS: Calsequestrin (CSQ) expression was reduced in Egr-1- and profoundly reduced in I293F-expressing cells. Calreticulin, triadin, sarcoendoplasmic reticulum ATPase 2a, phospholamban, and phosphoserine 16-phospholamban expression was unaffected. Calcium release from CSQ-dependent ryanodine-sensitive stores was reduced in Egr-1 and absent in I293F-expressing cells. In contrast, calcium release from calreticulin-dependent inositol 1,4,5-trisphosphate stores was unaffected. In vivo and in vitro chromatin immunoprecipitation demonstrated Egr-1 binding to the CSQ2 promoter. The Egr-1-binding region contains overlapping Egr-1, SP1, and nuclear factor of activated T-cells (NFAT) sites and a CpG island. Reciprocal immunoprecipitation coupled to immunoblots indicated Egr-1:NFAT3 binding was present in all cells lines. Treatment with cyclosporin A, inhibition of DNA methylation using 5-azadeoxycytidine, or inhibition of protein acetylation using sodium butyrate reduced CSQ expression. CONCLUSION: Our data suggest that Egr-1:DNA binding at the promoter, DNA methylation, and protein acetylation are important in CSQ repression. Moreover, we demonstrate that a reduction in CSQ protein is associated with abnormal calcium dynamics. We conclude that Egr-1 acts as a transcriptional repressor at the CSQ promoter, resulting in downregulation of CSQ, the major calcium storage protein that links excitation-contraction coupling in the cardiac sarcoendoplasmic reticulum.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCardiovascular ResearchMême sujetSignaling Pathways in DiseaseTravaux en français237 207