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Enregistrement W2171342112 · doi:10.1093/cvr/cvn357

Egr-1 negatively regulates calsequestrin expression and calcium dynamics in ventricular cells

2008· article· en· W2171342112 sur OpenAlexaff
Amanda Kasneci, Naomi M. Kemeny-Suss, Svetlana V. Komarova, Lorraine E. Chalifour

Notice bibliographique

RevueCardiovascular Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSignaling Pathways in Disease
Établissements canadiensJewish General HospitalMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCalsequestrinPhospholambanBiologyChromatin immunoprecipitationMolecular biologyCalreticulinImmunoprecipitationCell biologyCalcium-binding proteinEndoplasmic reticulumRyanodine receptorGene expressionCalciumChemistryPromoterBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: The transcription factor early growth response-1 (Egr-1) is increased in models of cardiac pathology; however, it is unclear how Egr-1 impacts the heart. We sought to identify how Egr-1 regulates expression of proteins involved in cardiomyocyte calcium homeostasis. METHODS: Protein expression was measured by immunoblotting in control cardiac differentiated H9c2 cells or in H9c2 cells overexpressing wild-type Egr-1 (Egr-1) or an Egr-1 (I293F) mutant. Microspectrofluorimetry of fura-2-loaded cells was used to study calcium dynamics. Chromatin immunoprecipitation with anti-Egr-1 antibody was used to identify Egr-1-associated DNA. RESULTS: Calsequestrin (CSQ) expression was reduced in Egr-1- and profoundly reduced in I293F-expressing cells. Calreticulin, triadin, sarcoendoplasmic reticulum ATPase 2a, phospholamban, and phosphoserine 16-phospholamban expression was unaffected. Calcium release from CSQ-dependent ryanodine-sensitive stores was reduced in Egr-1 and absent in I293F-expressing cells. In contrast, calcium release from calreticulin-dependent inositol 1,4,5-trisphosphate stores was unaffected. In vivo and in vitro chromatin immunoprecipitation demonstrated Egr-1 binding to the CSQ2 promoter. The Egr-1-binding region contains overlapping Egr-1, SP1, and nuclear factor of activated T-cells (NFAT) sites and a CpG island. Reciprocal immunoprecipitation coupled to immunoblots indicated Egr-1:NFAT3 binding was present in all cells lines. Treatment with cyclosporin A, inhibition of DNA methylation using 5-azadeoxycytidine, or inhibition of protein acetylation using sodium butyrate reduced CSQ expression. CONCLUSION: Our data suggest that Egr-1:DNA binding at the promoter, DNA methylation, and protein acetylation are important in CSQ repression. Moreover, we demonstrate that a reduction in CSQ protein is associated with abnormal calcium dynamics. We conclude that Egr-1 acts as a transcriptional repressor at the CSQ promoter, resulting in downregulation of CSQ, the major calcium storage protein that links excitation-contraction coupling in the cardiac sarcoendoplasmic reticulum.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil0,719

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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