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Enregistrement W2171342350 · doi:10.2174/138620707780126688

Homogenous Time Resolved Fluorescence Assay to Identify Modulators of Cap-Dependent Translation Initiation

2007· article· en· W2171342350 sur OpenAlexafffund
Regina Cencic, Yifei Yan, Jerry Pelletier

Notice bibliographique

RevueCombinatorial Chemistry & High Throughput Screening · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésFörster resonance energy transferIsothermal titration calorimetryInitiation factorHeterotrimeric G proteinBiophysicseIF4ARibosomeTranslation (biology)Eukaryotic translationHelicaseEukaryotic initiation factorSmall moleculeEIF4EChemistryCell biologyBiologyFluorescenceMessenger RNARNABiochemistrySignal transductionG proteinPhysicsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Eukaryotic initiation factor (eIF) 4F plays a key role in recruiting 40S ribosomes and associated factors to mRNA templates during translation initiation. The function of this heterotrimeric complex is to deliver an RNA helicase to the 5 cap proximal region of mRNAs in preparation for ribosome binding. To study the interaction between subunits of this complex, as well as identify small molecules that could interfere with their association, we developed a time resolved fluorescence assay that allows monitoring of interactions between two subunits of eIF4F. We have performed a small molecule chemical screen of > 73,000 compounds using this assay. Keywords: Time-resolved fluorescent resonance energy transfer, FRET signal, Isothermal Titration Calorimetry, Recombinant Proteins, Eukaryotic initiation factor 4E binding protein

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,113
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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