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Enregistrement W2171430909 · doi:10.1158/1055-9965.epi-12-0229

A Nonsynonymous Polymorphism in<i>IRS1</i>Modifies Risk of Developing Breast and Ovarian Cancers in<i>BRCA1</i>and Ovarian Cancer in<i>BRCA2</i>Mutation Carriers

2012· article· en· W2171430909 sur OpenAlexfundno aff
Yuan Chun Ding, Lesley McGuffog, Sue Healey, Eitan Friedman, Yael Laitman, Shani- Paluch–Shimon, Bella Kaufman, Annelie Liljegren, Annika Lindblom, Håkan Olsson, Ulf Kristoffersson, Marie Stenmark‐Askmalm, Beatrice Melin, Susan M. Domchek, Katherine L. Nathanson, Timothy R. Rebbeck, Anna Jakubowska, Jan Lubiński, Katarzyna Jaworska, Katarzyna Durda, Jacek Gronwald, Tomasz Huzarski, Cezary Cybulski, Tomasz Byrski, Ana Osório, Teresa Ramóny Cajal, Alexandra Stavropoulou, Javier Benı́tez, Ute Hamann, Matti A. Rookus, Cora M. Aalfs, Judith L. de Lange, Hanne Meijers‐Heijboer, Jan C. Oosterwijk, Christi J. van Asperen, E. Gómez, Agnes Jager, Rob B. van der Luijt, Douglas F. Easton, Susan Peock, Debra Frost, Steve D. Ellis, Radka Platte, Elena Fineberg, D. Gareth Evans, Fiona Lalloo, Louise Izatt, Rosalind A. Eeles, Julian Adlard, Rosemarie Davidson, Diana Eccles, Trevor Cole, Jackie Cook, Carole Brewer, Marc Tischkowitz, Andrew K. Godwin, Harsh B. Pathak, Dominique Stoppa‐Lyonnet, Olga M. Sinilnikova, Sylvie Mazoyer, Laure Barjhoux, Mélanie Léoné, Marion Gauthier‐Villars, Virginie Caux‐Moncoutier, Antoine De Pauw, Agnès Hardouin, Pascaline Berthet, Hélène Dreyfus, Sandra Fert Ferrer, Marie‐Agnès Collonge‐Rame, Johanna Sokolowska, Saundra Buys, Mary B. Daly, Alex Miron, Mary Beth Terry, Wendy K. Chung, Esther M. John, Melissa C. Southey, David E. Goldgar, Christian F. Singer, Muy-Kheng M. Tea, Daphne Gschwantler‐Kaulich, A. Fink-Retter, Thomas van Overeem Hansen, Bent Ejlertsen, Oskar T. Johannsson, Kenneth Offit, Kara Sarrel, Mia M. Gaudet, Joseph Vijai, Mark E. Robson, Marion Piedmonte, Lesley Andrews, David E. Cohn, Leslie R. DeMars, Paul DiSilvestro, Gustavo C. Rodriguez, Amanda E. Toland, Marco Montagna, Simona Agata, Evgeny Imyanitov, Claudine Isaacs, Ramūnas Janavičius, Conxi Lázaro, Ignacio Blanco, Susan J. Ramus, Lara Sucheston, Beth Y. Karlan, Jenny Gross, Patricia A. Ganz, Mary Beattie, Rita K. Schmutzler, Barbara Wappenschmidt, Alfons Meindl, Norbert Arnold, Dieter Niederacher, Sabine Preisler-Adams, D Gadzicki, Raymonda Varon-Mateeva, Helmut Deißler, Andrea Gehrig, Christian Sutter, Karin Kast, Heli Nevanlinna, Kristiina Aittomäki, Jacques Simard, Amanda B. Spurdle, Jonathan Beesley, Gail E. Tomlinson, Jeffrey N. Weitzel, Judy E. Garber, Olufunmilayo I. Olopade, Wendy S. Rubinstein, Nadine Tung, Joanne L. Blum, Steven A. Narod, Sean S. Brummel, Daniel L. Gillen, Noralane M. Lindor, Zachary Fredericksen, V. Shane Pankratz, Fergus J. Couch, Paolo Radice, Paolo Peterlongo, Mark H. Greene, Jennifer T. Loud, Irene L. Andrulis, Gord Glendon, Hilmi Özçelik, Anne‐Marie Gerdes, Mads Thomassen, Uffe Birk Jensen, Anne‐Bine Skytte, Maria A. Caligo, Andrew Lee, Georgia Chenevix‐Trench, Antonis C. Antoniou, Susan L. Neuhausen

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesBreast Cancer IrelandNational Institute of Environmental Health SciencesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute for Health and Care ResearchNational Cancer InstituteCancer Research UKNational Institutes of HealthNational Center for Research ResourcesCancer Research Institute
Mots-clésNonsynonymous substitutionOvarian cancerBreast cancerOncologyCancerInternal medicineMedicineGynecologyBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: We previously reported significant associations between genetic variants in insulin receptor substrate 1 (IRS1) and breast cancer risk in women carrying BRCA1 mutations. The objectives of this study were to investigate whether the IRS1 variants modified ovarian cancer risk and were associated with breast cancer risk in a larger cohort of BRCA1 and BRCA2 mutation carriers. METHODS: IRS1 rs1801123, rs1330645, and rs1801278 were genotyped in samples from 36 centers in the Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2 (CIMBA). Data were analyzed by a retrospective cohort approach modeling the associations with breast and ovarian cancer risks simultaneously. Analyses were stratified by BRCA1 and BRCA2 status and mutation class in BRCA1 carriers. RESULTS: Rs1801278 (Gly972Arg) was associated with ovarian cancer risk for both BRCA1 (HR, 1.43; 95% confidence interval (CI), 1.06-1.92; P = 0.019) and BRCA2 mutation carriers (HR, 2.21; 95% CI, 1.39-3.52, P = 0.0008). For BRCA1 mutation carriers, the breast cancer risk was higher in carriers with class II mutations than class I mutations (class II HR, 1.86; 95% CI, 1.28-2.70; class I HR, 0.86; 95%CI, 0.69-1.09; P(difference), 0.0006). Rs13306465 was associated with ovarian cancer risk in BRCA1 class II mutation carriers (HR, 2.42; P = 0.03). CONCLUSION: The IRS1 Gly972Arg single-nucleotide polymorphism, which affects insulin-like growth factor and insulin signaling, modifies ovarian cancer risk in BRCA1 and BRCA2 mutation carriers and breast cancer risk in BRCA1 class II mutation carriers. IMPACT: These findings may prove useful for risk prediction for breast and ovarian cancers in BRCA1 and BRCA2 mutation carriers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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