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Enregistrement W2171440950 · doi:10.3109/10428194.2014.970550

Combining MYC, BCL2 and TP53 gene and protein expression alterations improves risk stratification in diffuse large B-cell lymphoma

2014· article· en· W2171440950 sur OpenAlexaff
Idun Fiskvik, Klaus Beiske, Jan Delabie, Olav Erich Yri, Signe Spetalen, Marja-Liisa Karjalainen-Lindsberg, Sirpa Leppä, Knut Liestøl, Erlend B. Smeland, Harald Holte

Notice bibliographique

RevueLeukemia & lymphoma/Leukemia and lymphoma · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChromosomal translocationFluorescence in situ hybridizationImmunohistochemistryLymphomaInternal medicineCancer researchGene expressionOncologyGeneRisk stratificationProgression-free survivalBiologyMedicineOverall survivalGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Translocations affecting both MYC and BCL2 are associated with a poor prognosis in diffuse large B-cell lymphomas. We have examined genetic aberrations combined with analyses of protein expression of respective gene products. Fluorescence in situ hybridization (FISH) for translocations of BCL2 and MYC and del17p13 was performed. Immunohistochemistry analyses included BCL2, MYC and TP53 protein expression. Sixty-seven patients with high-risk DLBCL participating in a prospective multicenter study were included. Six patients with simultaneous translocations of BCL2 and MYC had impaired overall (OS) (p = 0.009) and progression-free survival (PFS) (p = 0.009). Six patients with high coexpression of MYC and BCL2 proteins also had impaired OS (p = 0.004) and PFS (p = 0.002). Combining these groups identified nine patients with impaired OS (p = 0.004) and PFS (p = 0.005). Sixteen patients had double-hit translocation or protein expression and/or del17p13 and/or high TP53. This combined endpoint was associated with impaired OS (p = 0.008) and PFS (p = 0.036), and identified 70% of all deaths.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,531
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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