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Enregistrement W2171665418 · doi:10.5897/jahr2013.0227

Association between ethnicity and human leukocyte antigen (HLA) alleles on late presentation to care and high rates of opportunistic infections in patients with HIV

2013· article· en· W2171665418 sur OpenAlexaboutno aff
Lauren J MacKenzie, Yoav Keynan, Marissa Becker, Leigh Anne Shafer, Souradet Y. Shaw, Bernie Lopko, Ken Kasper

Notice bibliographique

RevueJournal of AIDS and HIV Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHuman leukocyte antigenMedicineImmunologyDiseaseEthnic groupAllelePopulationEpidemiologyAntigenInternal medicineBiologyGeneticsEnvironmental healthGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Within Manitoba, Aboriginal people make up 15% of the province’s population, but accounted for 53% of new human immunodeficiency virus (HIV) diagnoses in 2011. For over a decade, research has linked the human leukocyte antigen (HLA) class I alleles as having both protective and harmful effects in HIV disease progression. The abundance of HLA alleles that predispose to rapid disease progression, together with the rarity of protective HLA allele types, may be a contributing factor to a more rapid disease progression amongst individuals of Aboriginal ethnicity. We completed an epidemiological study on all HIV patients new to care in the Manitoba HIV Program in 2010, looking at markers of disease severity, such as CD4 cell count, rates of opportunistic infections (OI), and HLA type. In this cohort, the Aboriginal population was overrepresented, and presented with significantly more advanced HIV infection (lower CD4 counts, higher rates of OI), compared to patients from a Caucasian background. Our data supports previously identified associations between HLA type and disease progression, and demonstrates a difference in distribution of HLA type by ethnicity.    Key words: Aboriginal, disease progression, ethnicity, HLA B27, HLA B35, HLA B51, HLA B5701, human immunodeficiency virus, human leukocyte antigen, opportunistic infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,089

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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