Association between ethnicity and human leukocyte antigen (HLA) alleles on late presentation to care and high rates of opportunistic infections in patients with HIV
Notice bibliographique
Résumé
Within Manitoba, Aboriginal people make up 15% of the province’s population, but accounted for 53% of new human immunodeficiency virus (HIV) diagnoses in 2011. For over a decade, research has linked the human leukocyte antigen (HLA) class I alleles as having both protective and harmful effects in HIV disease progression. The abundance of HLA alleles that predispose to rapid disease progression, together with the rarity of protective HLA allele types, may be a contributing factor to a more rapid disease progression amongst individuals of Aboriginal ethnicity. We completed an epidemiological study on all HIV patients new to care in the Manitoba HIV Program in 2010, looking at markers of disease severity, such as CD4 cell count, rates of opportunistic infections (OI), and HLA type. In this cohort, the Aboriginal population was overrepresented, and presented with significantly more advanced HIV infection (lower CD4 counts, higher rates of OI), compared to patients from a Caucasian background. Our data supports previously identified associations between HLA type and disease progression, and demonstrates a difference in distribution of HLA type by ethnicity. Key words: Aboriginal, disease progression, ethnicity, HLA B27, HLA B35, HLA B51, HLA B5701, human immunodeficiency virus, human leukocyte antigen, opportunistic infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».