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Enregistrement W2171686853 · doi:10.1073/pnas.182412499

Genetic and physiological data implicating the new human gene G72 and the gene for <scp>d</scp> -amino acid oxidase in schizophrenia

2002· article· en· W2171686853 sur OpenAlexaboutno aff
Ilya Chumakov, Marta Blumenfeld, Oxana Guerassimenko, Laurent Cavarec, Marta Palicio, Hadi Abderrahim, Lydie Bougueleret, Caroline Barry, Hiroaki Tanaka, Philippe La Rosa, Anne Puech, N. Tahri, Annick Cohen-Akenine, Sylvain Delabrosse, Sébastien Lissarrague, Françoise-Pascaline Picard, Karelle Maurice, Laurent Essioux, Philippe Millasseau, Pascale Grel, Virginie Debailleul, A M Simon, Dominique Caterina, Isabelle Dufaure, Kattayoun Malekzadeh, Maria Belova, Jian-Jian Luan, M Bouillot, Jean-Luc Sambucy, Gwenaël Primas, Martial Saumier, Nadia Boubkiri, Sandrine Martin-Saumier, M Nasroune, Hélène Peixoto, A Delaye, Virginie Pinchot, M Bastucci, Sophie Guillou, Magali Chevillon, Ricardo Sáinz‐Fuertes, S Meguenni, Joan Aurich‐Costa, Dorra Chérif, Anne Gimalac, Cornelia M. van Duijn, D. Gauvreau, Gail Ouelette, Isabel Fortier, John Realson, Tatiana Sherbatich, N Riazanskaia, Е. И. Рогаев, Peter Raeymaekers, Jeroen Aerssens, Frank Konings, Walter Luyten, Fabìo Macciardi, Pak C. Sham, Richard E. Straub, Daniel R. Weinberger, Nadine Cohen, Daniel Cohen

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAmino Acid Enzymes and Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismD-amino acid oxidaseGeneBiologyMolecular biologyGeneticsOxidase testGenotypeBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A map of 191 single-nucleotide polymorphism (SNPs) was built across a 5-Mb segment from chromosome 13q34 that has been genetically linked to schizophrenia. DNA from 213 schizophrenic patients and 241 normal individuals from Canada were genotyped with this marker set. Two 1,400- and 65-kb regions contained markers associated with the disease. Two markers from the 65-kb region were also found to be associated to schizophrenia in a Russian sample. Two overlapping genes G72 and G30 transcribed in brain were experimentally annotated in this 65-kb region. Transfection experiments point to the existence of a 153-aa protein coded by the G72 gene. This protein is rapidly evolving in primates, is localized to endoplasmic reticulum/Golgi in transfected cells, is able to form multimers and specifically binds to carbohydrates. Yeast two-hybrid experiments with the G72 protein identified the enzyme d-amino acid oxidase (DAAO) as an interacting partner. DAAO is expressed in human brain where it oxidizes d-serine, a potent activator of N-methyl-D-aspartate type glutamate receptor. The interaction between G72 and DAAO was confirmed in vitro and resulted in activation of DAAO. Four SNP markers from DAAO were found to be associated with schizophrenia in the Canadian samples. Logistic regression revealed genetic interaction between associated SNPs in vicinity of two genes. The association of both DAAO and a new gene G72 from 13q34 with schizophrenia together with activation of DAAO activity by a G72 protein product points to the involvement of this N-methyl-d-aspartate receptor regulation pathway in schizophrenia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,093

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations833
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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