Detection of <i>Chlamydia trachomatis</i> and <i>Neisseria gonorrhoeae</i> Infections in North American Women by Testing SurePath Liquid-Based Pap Specimens in APTIMA Assays
Notice bibliographique
Résumé
The APTIMA COMBO 2 assay, which detects and amplifies rRNA from Chlamydia trachomatis and/or Neisseria gonorrhoeae, is approved for use on ThinPrep liquid-based Pap test specimens. The objective was to determine the clinical utility of the APTIMA assays (APTIMA COMBO 2 assay, APTIMA CT assay for Chlamydia trachomatis, and APTIMA GC assay for Neisseria gonorrhoeae) for screening women during their annual Pap exam, using SurePath liquid-based Pap test specimens. Two cervical samples were collected from 1,615 females attending six clinical sites in North America. A cervical broom sample was processed for cytology, with the residuum aliquoted into an APTIMA specimen transfer kit tube. The second cervical swab sample was put into APTIMA specimen transport medium, and both samples were tested with each APTIMA assay on a direct sampling system. Using a subject-infected status that utilized cervical-swab specimen results from two APTIMA assays, the prevalence was 7.9% for Chlamydia trachomatis and 2.5% for N. gonorrhoeae. For the liquid-based Pap samples, the sensitivities, specificities, positive predictive values, and negative predictive values for Chlamydia trachomatis detection were 85.2%, 99.5%, 93.2%, and 98.7%, respectively, for the APTIMA COMBO 2 assay and 89.1%, 98.7%, 85.7%, and 99.1%, respectively, for the APTIMA CT assay. For N. gonorrhoeae detection, the values were 92.5%, 100%, 100%, and 99.8%, respectively, for the APTIMA COMBO 2 assay and 92.5%, 99.9%, 97.4%, and 99.8%, respectively, for the APTIMA GC assay. The high predictive values support the use of the assays with SurePath liquid-based Pap specimens processed with the APTIMA specimen transfer kit.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».