Prevalence and diversity of avian influenza viruses in environmental reservoirs
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Little is known about the ecology and evolution of avian influenza in the natural environment, despite how these affect the potential for transmission. Most work has focused on characterizing viruses isolated from hosts such as waterfowl, and there have also been several instances of isolation and detection from abiotic sources such as water and ice. We used RT-PCR to amplify and characterize the influenza virus sequences present in sediments of ponds that are used heavily by waterfowl. The detection rate of influenza virus was high (>50%). Characterization of the viruses present by sequencing part of the haemagglutinin (HA) gene showed that there is a diverse collection of viruses in these sediments. We sequenced 117 partial HA gene clones from 11 samples and detected four different HA subtypes (H3, H8, H11 and H12), with approximately 65% of clone sequences being unique. This culture-independent approach was also able to detect a virus subtype that was not found by sampling of birds in the same geographical region in the same year. Viruses were detected readily in the winter when the ponds were frozen, indicating that these sediments could be a year-to-year reservoir of viruses to infect birds using the ponds, although we have not shown that these viruses are viable. We demonstrate that this approach is a feasible and valuable way to assess the prevalence and diversity of viruses present in the environment, and can be a valuable complement to more difficult viral culturing in attempting to understand the ecology of influenza viruses.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle