Genetic analysis of mitochondrial complex II subunits <i>SDHD</i>, <i>SDHB</i> and <i>SDHC</i> in paraganglioma and phaeochromocytoma susceptibility
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Germline mutations in three subunits of mitochondrial complex II (SDHB, SDHC and SDHD) may be associated with susceptibility to phaeochromocytoma (PC) and/or head and neck paraganglioma (HNPGL). METHODS: To further define the role of SDH subunit mutations in these disorders, we analysed a series of 22 probands with PC and evidence of genetic susceptibility (seven with familial PC only, one with familial PC and HNPGL, 10 sporadic cases with multiple PC and four cases of isolated paediatric onset PC) for germline SDHB, SDHC and SDHD mutations. In addition, we analysed 34 cases of HNPGL (30 isolated cases with single tumours, three isolated cases with multiple tumours and one familial case with multiple tumours) for somatic and germline mutations in SDHB, SDHC and SDHD. RESULTS: We identified four germline mutations (three SDHB and one SDHD, three novel) in the 22 PC probands. Combining these results with our previous series, we have detected germline SDHB or SDHD mutations in 2/12 (17%) of familial PC only kindreds, 4/5 (80%) of familial PC and HNPGL cases, 1/10 of sporadic multiple PC cases and 2/4 (50%) of paediatric PCs. No somatic mutations were detected in the HNPGL tumours, but four cases with multiple HNPGL had the common P81L germline SDHD mutation. Intriguingly a silent SNP (c.204C > T) in SDHD was significantly more common in HNPGL cases (6/34) than in controls (1/100, P = 0.0011). Combining our results with those from two other large studies in which both SDHB and SDHD have been analysed, SDHB mutations were most commonly associated with phaeochromocytoma susceptibility and SDHD with the development of HNPGL (P = 0.025). However, germline SDHB and SDHD mutations demonstrate considerable phenotypic variability and genotype-phenotype correlations are complex. CONCLUSION: The significantly lower frequency (P = 0.028) of germline SDH subunit mutations in familial PC only cases compared to those with familial PC and HNPGL suggests that further PC susceptibility gene(s) remain to be identified.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».