Nucleus‐ and nucleomorph‐targeted histone proteins in a chlorarachniophyte alga
Notice bibliographique
Résumé
The plastid of chlorarachniophytes is distinguished by the retention of a relict nucleus (nucleomorph) derived from a green algal endosymbiont, which is located in the periplastidal compartment (PPC). The nucleomorph genome of a chlorarachniophyte, Bigelowiella natans, encodes several plastid-targeted proteins and hundreds of housekeeping proteins, but it lacks many fundamental genes to maintain itself. Here we report the first two host nucleus-encoded genes for proteins targeted to the nucleomorph, histone H2A and H2B. We identified 20 histone genes from the host nuclear genome, and based on phylogenetic analyses predicted that most of these are derived from the host, but that two histone genes are symbiont-derived. The genes both encode N-terminal extensions resembling PPC targeting signals, further suggesting they function in the nucleomorph. Using green fluorescent protein (GFP) fusion proteins expressed in transformed cells, we confirmed that the putative symbiont H2A and H2B were targeted into the nucleomorph, whereas putative host proteins were localized to the host nucleus. Furthermore, we have developed a method to temporarily synchronize B. natans cells, and confirmed that both host and symbiont histone expression is controlled during the cell cycle. Our findings provide the first evidence of how the nucleomorph may be regulated by host-encoded gene products.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».