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Enregistrement W2171975491 · doi:10.1158/0008-5472.can-05-0500

Identification of a Novel c-Myc Protein Interactor, JPO2, with Transforming Activity in Medulloblastoma Cells

2005· article· en· W2171975491 sur OpenAlexaff
Annie Huang, Cynthia S.W. Ho, Romina Ponzielli, Dalia Baršytė-Lovejoy, Éric Bouffet, Daniel Picard, Cynthia Hawkins, Linda Z. Penn

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaCancer researchBiologyGene knockdownOncogeneRNA interferenceNeoplastic transformationPhenotypeMalignant transformationCell cultureCarcinogenesisCancerGeneticsCell cycleGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

c-myc oncogene activation is critical in the pathogenesis of a spectrum of human malignancies. The c-Myc NH2-terminal domain (MycNTD) is essential for cellular transformation, and mediates critical protein interactions that modulate c-Myc oncogenic properties. In medulloblastoma, the most common malignant pediatric brain tumor, deregulated c-myc expression is linked with poorer disease phenotypes and outcomes. The biological basis for these associations is, however, not well understood. To better understand mechanisms underlying Myc-mediated transformation of medulloblastoma, we sought to identify novel MycNTD protein interactors from a medulloblastoma cell line library using a unique two-hybrid system. We identified a novel MycNTD binding protein, JPO2, which shows nuclear colocalization with c-Myc, and interacts with c-Myc both in vitro and in mammalian cells. In Rat1a transformation assays, JPO2 potentiates c-Myc transforming activity, and can complement a transformation-defective Myc mutant. Immunohistochemical studies indicate tumor-specific JPO2 expression in human medulloblastoma, and an association of JPO2 expression with metastatic tumors. Significantly, JPO2 expression induces colony formation in UW228, a medulloblastoma cell line, whereas RNAi-mediated JPO2 knockdown impairs colony formation in UW228, and in Myc-transformed UW228 cells. These data provide evidence for biochemical and functional interaction between c-Myc and JPO2 in medulloblastoma transformation. JPO2 is closely related to JPO1, a Myc transcriptional target with transforming activity. As tumor-specific JPO1 expression in human and murine medulloblastoma has also been reported; these collective observations suggest important functional links between the novel JPO protein family and c-Myc in medulloblastoma transformation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,283

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations84
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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