Quantitative trait loci in Anopheles gambiae controlling the encapsulation response against Plasmodium cynomolgi Ceylon
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Anopheles gambiae females are the world's most successful vectors of human malaria. However, a fraction of these mosquitoes is refractory to Plasmodium development. L3-5, a laboratory selected refractory strain, encapsulates transforming ookinetes/early oocysts of a wide variety of Plasmodium species. Previous studies on these mosquitoes showed that one major (Pen1) and two minor (Pen2, Pen3) autosomal dominant quantitative trait loci (QTLs) control the melanotic encapsulation response against P. cynomolgi B, a simian malaria originating in Malaysia. RESULTS: We have investigated the response of L3-5 to infection with P. cynomolgi Ceylon, a different but related parasite species, in crosses with the susceptible strain 4Arr. Refractoriness to this parasite is incompletely recessive. Infection and genotyping of F2 intercross females at genome-spanning microsatellite loci revealed that 3 autosomal QTLs control encapsulation of this species. Two loci map to the regions containing Pen2 and Pen3. The novel QTL maps to chromosome 3R, probably to polytene division 32 or 33. Thus the relative contribution of any QTL to oocyst encapsulation varies with the species of parasite. Further, different QTLs were most readily identified in different F2 families. This, like the F1 data, suggests that L3-5 is not genetically homogeneous and that somewhat different pathways may be used to achieve an encapsulation response. CONCLUSION: We have shown here that different QTLs are involved in responses against different Plasmodium parasites.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».