The Idd4 Locus Displays Sex-Specific Epistatic Effects on Type 1 Diabetes Susceptibility in Nonobese Diabetic Mice
Notice bibliographique
Résumé
The nonobese diabetic (NOD) mouse recapitulates many aspects of the pathogenesis of type 1 diabetes in humans, including inheritance as a complex trait. More than 20 Idd loci have been linked to type 1 diabetes susceptibility in NOD mice. Previously, we used linkage analysis of NOD crossed to the nonobese diabetes-resistant (NOR) strain and NOD congenic strains to map susceptibility to both spontaneous and cyclophosphamide-accelerated type 1 diabetes to the Idd4 locus on chromosome 11 that displayed a sex-specific effect on diabetes susceptibility. Here, we elucidate the complex genetic architecture of Idd4 by analysis of congenic strains on the NOD and NOR backgrounds. We previously refined Idd4.1 to 1.4 Mb and demonstrated an impact of this interval on type 1 interferon pathways in antigen-presenting cells. Here, we identify a second subregion, the 0.92 Mb Idd4.2 locus located telomeric to Idd4.1. Strikingly, Idd4.2 displayed a sex-specific, epistatic interaction with Idd4.1 in NOR.NOD congenic females that was not observed in syngenic males. Idd4.2 contains 29 genes, and promising candidates for the Idd4.2 effect on type 1 diabetes are described. These data demonstrate sex-dependent interaction effects on type 1 diabetes susceptibility and provide a framework for functional analysis of Idd4.2 candidate genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».