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Enregistrement W2172099127 · doi:10.1093/hmg/ddl166

P2RX7, a gene coding for a purinergic ligand-gated ion channel, is associated with major depressive disorder

2006· article· en· W2172099127 sur OpenAlexaff
Susanne Lucae, Daria Salyakina, Nicholas Barden, Mario Harvey, Bernard Gagné, Michel Labbé, Elisabeth B. Binder, Manfred Uhr, Marcelo Páez-Pereda, Inge Sillaber, Marcus Ising, Tanja Brückl, Roselind Lieb, Bertram Müller-Myhsok

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdenosine and Purinergic Signaling
Établissements canadiensWilfrid Laurier UniversityUniversité Laval
Organismes subventionnairesBundesministerium für Bildung und Forschung
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismBiologyGeneticsPurinergic receptorLocus (genetics)Major depressive disorderGeneSNPCoding regionAllelePopulationGenotypeReceptorEndocrinologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The P2RX7 gene is located within a region on chromosome 12q24.31 that has been identified as a susceptibility locus for affective disorders by linkage and association studies. P2RX7 is a purinergic ATP-binding calcium channel expressed in neurons as well as in microglial cells in various brain regions. We investigated 29 single nucleotide polymorphisms (SNPs) within the P2RX7 gene and adjacent genes in a sample of 1000 German Caucasian patients suffering from recurrent major depressive disorder (MDD). These were contrasted with diagnosed healthy Caucasian controls from the same population (n=1029). A non-synonymous coding SNP in the P2RX7 gene (rs2230912), previously found to be associated with bipolar disorder, was significantly associated (P=0.0019) with MDD. This polymorphism results in an amino acid exchange in the C-terminal cytosolic domain of the P2RX7 channel protein, suggesting that the observed P2RX7 polymorphism might play a causal role in the development of depression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations255
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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