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Enregistrement W2172171480 · doi:10.1071/en12106

The role of charge on the diffusion of solutes and nanoparticles (silicon nanocrystals, nTiO2, nAu) in a biofilm

2013· article· en· W2172171480 sur OpenAlexaff
Mahmood Golmohamadi, Rhett J. Clark, Jonathan G. C. Veinot, Kevin J. Wilkinson

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversité de MontréalUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiofilmDiffusionChemistryNanoparticleContext (archaeology)Fluorescence recovery after photobleachingSurface chargeNanomaterialsChemical physicsNanotechnologyChemical engineeringMaterials scienceBacteriaPhysical chemistryThermodynamicsPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Environmental context The mobility and bioavailability of both contaminants and nutrients in the environment depends, to a large extent, on their diffusion. Because the majority of microorganisms in the environment are embedded in biofilms, it is essential to quantify diffusion in biofilms in order to evaluate the risk of emerging contaminants, including nanomaterials and charged solutes. This study quantifies diffusion, in a model environmental biofilm, for a number of model contaminants of variable size and charge. Abstract The effect of solute and biofilm charge on self-diffusion (Brownian motion) in biofilms is examined. Diffusion coefficients (D) of several model (fluorescent) solutes (rhodamine B; tetramethylrhodamine, methyl ester; Oregon Green 488 carboxylic acid, succinimidyl ester and Oregon Green 488 carboxylic acid) and nanoparticles (functionalised silicon, gold and titanium) were determined using fluorescence correlation spectroscopy (FCS). Somewhat surprisingly, little effect due to charge was observed on the diffusion measurements in the biofilms. Furthermore, the ratio of the diffusion coefficient in the biofilm with respect to that in water (Db/Dw) remained virtually constant across a wide range of ionic strengths (0.1–100 mM) for both negatively and positively charged probes. In contrast, the self-diffusion coefficients of nanoparticles with sizes >10 nm greatly decreased in the biofilms with respect to those in water. Furthermore, much larger nanoparticles (>66 nm) appeared to be completely excluded from the biofilms. The results indicated that for many oligotrophic biofilms in the environment, the diffusion of solutes and nanoparticles will be primarily controlled by obstruction rather than electrostatic interactions. The results also imply that most nanomaterials will become significantly less mobile and less bioavailable (to non-planktonic organisms) as they increase in size beyond ~10 nm.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,165
Écart entre enseignants0,162 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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