Genetic diversity in conventional and synthetic wheats with drought and salinity tolerance based on AFLP
Notice bibliographique
Résumé
Genetic diversity among 14 drought tolerance (drought accessions) and 27 salinity tolerance (salinity accesions) related conventional and synthetic wheat (Triticum sp.) accessions containing different sources of the D genome was assessed using amplified fragment length polymorphism (AFLP). The wheat accessions were analyzed with 20 EcoRI/MseI primer combinations. Among 918 fragments scored, 368 were polymorphic across all 41 wheat accessions, 348 were polymorphic among the drought accessions and 310 were polymorphic among the salinity accessions. Similarity coefficients among all accessions based on Jaccard’s coefficient ranged from 0.18 to 0.92 with an average of 0.53 ± 0.01; among drought accessions, from 0.16 to 0.79 with an average of 0.43 ± 0.02; and among salinity accessions, from 0.16 to 0.92 with an average of 0.57 ± 0.01. Polymorphic information content (PIC) among all accessions ranged from 0.05 to 0.50 with an average PIC of 0.30 ± 0.01; among drought accessions, from 0.13 to 0.50 with an average PIC of 0.37 ± 0.01; and among salinity accessions, from 0.07 to 0.50 with an average PIC of 0.29 ± 0.01. Cluster and principal component analysis showed distinct groups of accessions both within drought and salinity entries. These accessions possess a substantial amount of genetic diversity and would be very valuable materials for breeding wheat with drought and salinity tolerance. Key words: AFLP, DNA fingerprinting, genetic diversity, synthetic wheat
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».