A Multiplex Real-Time PCR Assay for Screening Gypsy Moths (Lepidoptera: Erebidae) in the United States for Evidence of an Asian Genotype
Notice bibliographique
Résumé
European gypsy moth populations (Lymantria dispar L.) are well established and a proven destructive force in hardwood trees throughout the United States and Canada. Introduction of the exotic Asian gypsy moth into North America would be even more impactful, as Asian gypsy moth populations have wider host ranges, and are capable of naturally dispersing more rapidly due to female flight ability. To support early detection and exclusion of Asian gypsy moth, the U.S. Department of Agriculture (USDA) uses molecular techniques to screen moths trapped in North America for evidence of common Asian genotype. In order to strengthen U.S. domestic capacity to screen moths quickly and efficiently, we report a real-time PCR assay for this pest. A probe system using TaqMan 5' nuclease chemistry is reported for detection of an allele associated with common Asian gypsy moth genotypes. The targeted allele is located at the nuclear FS1 locus currently used by the USDA in conventional PCR tests to screen for evidence of Asian gypsy moth introductions or introgression. The diagnostic probe is successfully multiplexed with a conserved 18S probe system to detect reaction failure due to poor sample quality or quantity. The specificity, sensitivity, and repeatability of the FS1-18S multiplex real-time PCR assay were tested on laboratory-reared and field-collected moths to demonstrate diagnostic utility. Implications of the new assay as a screening tool for evidence of Asian gypsy moth introgression and introduction are discussed.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».