MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2172573144 · doi:10.1186/s12896-015-0199-8

Identification and characterization of a novel stress-responsive outer membrane protein Lip40 from Actinobacillus pleuropneumoniae

2015· article· en· W2172573144 sur OpenAlexfundno aff
Xuehe Hu, Hao Yan, Ke Liu, Jiansheng Hu, Chao Qi, Jihong Yang, Yanli Liu, Jin Zhao, Jinlin Liu

Notice bibliographique

RevueBMC Biotechnology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMicrobial infections and disease research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFundamental Research Funds for the Central UniversitiesHuazhong Agricultural UniversityCentral China Normal UniversityUniversity of TorontoNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésActinobacillus pleuropneumoniaeBacterial outer membraneBiologyMicrobiologyVirulenceEscherichia coliVirologySerotypeGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Actinobacillus pleuropneumoniae, a Gram-negative bacterium, is the causative agent of porcine pleuropneumonia, a highly contagious and often fatal disease. Because current vaccines confer limited protection against A. pleuropneumoniae infection, the development of more effective vaccines is urgently required. The identification of immunogenic and protective antigens, such as an outer-membrane lipoprotein, will advance this purpose. RESULTS: Sixty putative lipoproteins were predicted from the genomic sequence of A. pleuropneumoniae using multiple algorithms. Here, we focused on the characteristics of the putative lipoprotein Lip40 from A. pleuropneumoniae strain SLW01 (serovar 1). Lip40 shares sequence similarity with many bacterial lipoproteins, and the structural prediction of Lip40 suggests that it is similar to A. pleuropneumoniae TbpB. The N-terminus of Lip40 contains an interesting tandemly repeated sequence, Q(E/D/P)QPK. Real-time RT-PCR indicated that the expression of lip40 was significantly upregulated at 42 °C, at 16 °C, and under anaerobic conditions. Recombinant Lip40 (rLip40) produced in Escherichia coli BL21(DE3) was specifically recognized by porcine convalescent serum directed against A. pleuropneumoniae. Lip40 was confirmed to localize at the bacterial outer membrane, and its expression was significantly stimulated when A. pleuropneumoniae was cultured under various stress conditions. Lip40 also protected 75% of mice from fatal virulent A. pleuropneumoniae infection. CONCLUSIONS: The immunogenic outer-membrane protein Lip40 is stress responsive, protects mice against infection, and might be a virulence determinant. Further investigation of Lip40 should expedite vaccine development and provide insight into the pathogenesis of A. pleuropneumoniae.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,544

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBMC BiotechnologyMême sujetMicrobial infections and disease researchTravaux en français237 207