Structural Mechanism of the Interaction of Alzheimer Disease Aβ Fibrils with the Non-steroidal Anti-inflammatory Drug (NSAID) Sulindac Sulfide
Notice bibliographique
Résumé
Alzheimer disease is the most severe neurodegenerative disease worldwide. In the past years, a plethora of small molecules interfering with amyloid-β (Aβ) aggregation has been reported. However, their mode of interaction with amyloid fibers is not understood. Non-steroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs) are known γ-secretase modulators; they influence Aβ populations. It has been suggested that NSAIDs are pleiotrophic and can interact with more than one pathomechanism. Here we present a magic angle spinning solid-state NMR study demonstrating that the NSAID sulindac sulfide interacts specifically with Alzheimer disease Aβ fibrils. We find that sulindac sulfide does not induce drastic architectural changes in the fibrillar structure but intercalates between the two β-strands of the amyloid fibril and binds to hydrophobic cavities, which are found consistently in all analyzed structures. The characteristic Asp(23)-Lys(28) salt bridge is not affected upon interacting with sulindac sulfide. The primary binding site is located in the vicinity of residue Gly(33), a residue involved in Met(35) oxidation. The results presented here will assist the search for pharmacologically active molecules that can potentially be employed as lead structures to guide the design of small molecules for the treatment of Alzheimer disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».