Evaluation of Sampling and Testing Efficiencies of <i>Plum pox virus</i> Eradication Programs in Pennsylvania and Ontario
Notice bibliographique
Résumé
Plum pox virus (PPV) was first detected in the United States in Pennsylvania in 1999 and in Ontario, Canada in 2000. Following a 10-year survey and eradication program, PPV was officially declared eradicated in Pennsylvania in 2009. Although incidence of PPV was greatly reduced from 2000 to 2008, PPV remains present in Ontario. The objective of this study was to compare how the Pennsylvania and Ontario PPV eradication programs affected the probability of detecting PPV at the leaf, scaffold, tree, and Prunus orchard block scales. A simulation model was developed to evaluate the sampling and testing efficiency of the two programs. At the tree scale, the Pennsylvania sampling and detection protocols had a detection efficiency of 71.8% compared with 40.5% for the Ontario program. Several components in the Pennsylvania and Ontario PPV eradication programs affected PPV detection efficiency. A stratified (by tree scaffold) random sampling design did not improve PPV detection efficiency in either program, compared with a simple random sampling design to select leaves for enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) testing. Detection efficiency for both programs increased with sample size but gains in detection efficiency diminished as sample size increased. There was good agreement (between the commercial ELISA kit used in Pennsylvania and the kit used in Ontario) at the leaf and scaffold scales but not the tree scale. Based on simulation modeling, the Pennsylvania PPV eradication program required that >2 PPV-positive trees must be present within a Prunus block to achieve a 95% probability of correctly detecting PPV at the block scale, whereas the Ontario program required >5 PPV-positive trees within a block to achieve 95% probability of detection. The results from this study have important implications with regard to the efficiency of the two eradication programs to detect PPV-positive trees.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».