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Enregistrement W2174154595 · doi:10.1002/jcc.24223

The barrier to the methyl rotation in<scp><i>C</i></scp><i>is</i>‐2‐butene and its isomerization energy to<scp><i>T</i></scp><i>rans</i>‐2‐butene, revisited

2015· article· en· W2174154595 sur OpenAlexaff
Chérif F. Matta, Seyed Abdolreza Sadjadi, Dale A. Braden, Gernot Frenking

Notice bibliographique

RevueJournal of Computational Chemistry · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMolecular spectroscopy and chirality
Établissements canadiensSaint Mary's UniversityMount Saint Vincent UniversityDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryIsomerizationMolecule2-ButeneHydrogen bondComputational chemistryPotential energyCrystallographyAtomic physicsPhysicsCatalysisOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We respond to the two questions posed by Weinhold, Schleyer, and McKee (WSM) in their study of cis-2-butene (Weinhold et al., J Comput Chem 2014, 35, 1499), in which they solicit explanations for the relative conformational energies of this molecule in terms of the Quantum Theory of Atoms in Molecules (QTAIM). WSM requested answers to the questions: (1) why is cis-2-butene less stable than trans-2-butene despite the presence of a hydrogen-hydrogen (H⋯H) bond path in the former but not in the latter if the H⋯H bond path is stabilizing? (2) Why is the potential well of the conformational global minimum of cis-2-butene only 0.8 kcal/mol deep when the H⋯H bonding is stabilizing by 5 kcal/mol? Both questions raised by WSM are answered by considering the changes in the energies of all atoms as a function of the rotation of one of the two methyl groups from the minimum-energy structure, which exhibits the H⋯H bond path, to the transition state, which is devoid of this bond path. It is found that the stability gained by the H⋯H bonding interaction is cancelled by the destabilization of one of the ethylenic carbon atoms which, alone, destabilizes the system by as much as 5 kcal/mol in the global minimum conformation. Further, it is found that the 1.1 kcal/mol stability of trans-2-butene with respect to the cis-isomer is driven by the considerable destabilization of the ethylenic carbons by 11 kcal/mol, while the changes in the atomic energies of the other corresponding atoms in the two isomers account for the observed different stabilities. The error introduced into QTAIM atomic energies by neglecting the virials of the forces on the nuclei for partially optimized structures is discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,003
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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