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Enregistrement W2174562498 · doi:10.1139/cjm-2015-0328

Molecular and insecticidal characterization of Vip3A protein producing <i>Bacillus thuringiensis</i> strains toxic against <i>Helicoverpa armigera</i> (Lepidoptera: Noctuidae)

2015· article· en· W2174562498 sur OpenAlexvenueno aff
Showkat Ahmad Lone, Radha Yadav, Abdul Malik, Jasdeep Chatrath Padaria

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInsect Resistance and Genetics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesIndian Council of Agricultural ResearchAligarh Muslim UniversityUniversity Grants CommissionNational Research CentreOhio State University
Mots-clésBacillus thuringiensisHelicoverpa armigeraNoctuidaeBiologyBiopesticideLepidoptera genitaliaHelicoverpaPEST analysisGeneMicrobiologyBotanyPesticideBacteriaBiochemistryGeneticsAgronomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vegetative insecticidal proteins (Vip) represent the second generation of insecticidal proteins produced by Bacillus thuringiensis (Bt) during the vegetative growth stage of growth. Bt-based biopesticides are recognized as viable alternatives to chemical insecticides; the latter cause environmental pollution and lead to the emergence of pest resistance. To perform a systematic study of vip genes encoding toxic proteins, a total of 30 soil samples were collected from diverse locations of Kashmir valley, India, and characterized by molecular and analytical methods. Eighty-six colonies showing Bacillus-like morphology were selected. Scanning electron microscopy observations confirmed the presence of different crystal shapes, and PCR analysis of insecticidal genes revealed a predominance of the lepidopteran-specific vip3 (43.18%) gene followed by coleopteran-specific vip1 (22.72%) and vip2 (15.90%) genes in the isolates tested. Multi-alignment of the deduced amino acid sequences revealed that vip3 sequences were highly conserved, whereas vip1 and vip2 showed adequate differences in amino acid sequences compared with already reported sequences. Screening for toxicity against Helicoverpa armigera larvae was performed using partially purified soluble fractions containing Vip3A protein. The mortality levels observed ranged between 70% and 96.6% in the isolates. The LC50 values of 2 of the native isolates, JK37 and JK88, against H. armigera were found to be on par with that of Bt subsp. kurstaki HD1, suggesting that these isolates could be developed as effective biopesticides against H. armigera.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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