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Enregistrement W2174683547 · doi:10.1042/bj20150222

PDLIM7 is a novel target of the ubiquitin ligase Nedd4-1 in skeletal muscle

2015· article· en· W2174683547 sur OpenAlexafffund
Robert D’Cruz, Pamela Plant, Lesley A. Pablo, Shouzhe Lin, Joshua Chackowicz, Judy Correa, James R. Bain, Jane Batt

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoMcMaster UniversitySt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSkeletal muscleUbiquitin ligaseMyogenesisUbiquitinMuscle atrophyMyocyteBiologyNEDD4Cell biologyHEK 293 cellsDenervationC2C12Internal medicineEndocrinologyBiochemistryMedicineReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Skeletal muscle atrophy remains a complication occurring both as a natural response to muscle disuse and as a pathophysiological response to illness such as diabetes mellitus and nerve injury, such as traumatic muscle denervation. The ubiquitin-proteasome system (UPS) is the predominant proteolytic machinery responsible for atrophy of skeletal muscle, and Nedd4-1 (neural precursor cell-expressed developmentally down-regulated 4-1) is one of a series of E3 ubiquitin ligases identified to mediate inactivity-induced muscle wasting. Targets of Nedd4-1 mediated ubiquitination in skeletal muscle remain poorly understood. In the present study, we identified PDLIM7 (PDZ and LIM domain 7, Enigma), a member of the PDZ-LIM family of proteins, as a novel target of Nedd4-1 in skeletal muscle. The PDZ-LIM family of proteins is known to regulate muscle development and function. We show that Nedd4-1 expression in muscle atrophied by denervation is co-incident with a decrease in PDLIM7 and that PDLIM7 protein levels are stabilized in denervated muscle of Nedd4-1 skeletal muscle-specific knockout mice (SMS-KO). Exogenous PDLIM7 and Nedd4-1 transfected into human embryonic kidney (HEK)293 cells co-immunoprecipitate through binding between the PY motif of PDLIM7 and the second and third WW domains of Nedd4-1 and endogenous PDLIM7 and Nedd4-1 interact in the cytoplasm of differentiated C2C12 myotubes, leading to PDLIM7 ubiquitination. These results identify PDLIM7 as a bona fide skeletal muscle substrate of Nedd4-1 and suggest that this interaction may underlie the progression of skeletal muscle atrophy. This offers a novel therapeutic target that could be potentially used to attenuate muscle atrophy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,058
Score d'incertitude au seuil0,272

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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