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Enregistrement W2176183558 · doi:10.1111/j.0014-3820.2005.tb00933.x

TESTING HYPOTHESES ABOUT ECOLOGICAL SPECIALIZATION USING PHYLOGENETIC TREES

2005· article· en· W2176183558 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueEvolution · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueEvolution and Paleontology Studies
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSimon Fraser University
Mots-clésBiologyPhylogenetic treeEcologyPhylogenetic comparative methodsEvolutionary biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It is often assumed that ecological specialization represents an evolutionary "dead-end" that limits further evolution. Maximum-likelihood (ML) analyses on phylogenies for 15 groups of phytophagous insects revealed that high transition rates both to and from specialization occurred, but that the mean ratio of rates was significantly biased toward a higher rate to specialization. Here we explore the consequences of the fact that transition rates inferred by ML are affected not only by the distribution, but also by the frequency, of character states. Higher rates to the more common state were inferred in the analyses of Nosil (2002), in similar studies published since 2002, and in a small set of simulations. Thus, the ratio of the rate toward versus away from specialization was strongly, positively correlated with the proportion of specialist species at the tips of the phylogeny and whether transitions away from specialization occur remains unclear. Here we reexamine these data using methods that do not rely on directly comparing transition rates. Maximum-likelihood analyses show that models with no transitions in one direction (e.g., irreversible evolution as predicted by the "specialist as dead end" framework) are usually strongly rejected, independent of the proportion of specialists at the tips. Ancestral state reconstruction revealed two instances where generalists were unambiguously derived from specialists. Transition rates would need to biased 100-fold and 5000-fold toward specialization to reconstruct a history where these shifts from specialization toward generalization do not occur. The general conclusions of Nosil (2002) appear to hold; transitions in either direction likely occur such that specialization does not always limit further evolution. Most generally, inferences regarding character evolution can be strengthened by comparing models of character change and examining ancestor states, rather than only comparing parameter values.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,062
Score d'incertitude au seuil0,984

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle