Relationship Between H5N2 Avian Influenza Viruses Isolated from Wild and Domestic Ducks in British Columbia, Canada
Notice bibliographique
Résumé
In the summer of 2005 a Canadian national surveillance program for influenza A viruses in wild aquatic birds was initiated. The program involved collaboration between federal and provincial levels of government and was coordinated by the Canadian Cooperative Wildlife Health Centre. The surveillance plan targeted young-of-the-year Mallards along with other duck species at six sampling locations along the major migratory flyways across Canada. Beginning in early August, cloacal swabs were taken from 704 ducks on two lakes adjacent to one another near Kamloops, British Columbia. The swabs were screened for the presence of influenza A RNA using a real-time reverse transcription-polymerase chain reaction (RRT-PCR) assay that targets the M1 gene. Swab samples that gave positive results underwent further testing using H5- and H7-specific RRT-PCR assays. One hundred and seventy-four cloacal swab specimens gave positive or suspicious results for the presence of an H5 virus. A portion of these (28/35) were confirmed using an H5-specific conventional reverse transcription-polymerase chain reaction assay and an H5 virus was eventually isolated from 24/127 swab specimens. Neuraminidase typing revealed the presence of H5N2 and H5N9 viruses. In mid-November of 2005 an H5N2 virus was detected in a commercial duck operation in the lower mainland of British Columbia, approximately 120 km from where the H5N2-positive wild ducks were sampled. Molecular genetic analysis of the H5N2 viruses isolated from wild and domestic ducks was carried out to determine their kinship.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».