Cloning, characterization and expression analysis of a 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase gene from pear
Notice bibliographique
Résumé
Shi, H., Zhang, Y. and Chen, L. 2013. Cloning, characterization and expression analysis of a 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase gene from pear. Can. J. Plant Sci. 93: 465–471. In this study, a cDNA clone encoding putative 1-aminocyclopropane-1-carboxylate (ACC) synthase (ACS) that catalyzes the conversion of S-adenosyl-L-methionine to ACC in ethylene biosynthetic pathway was isolated from a cDNA library produced using mRNA from pear (Pyrus pyrifolia). The cDNA clone, designated PpACS2, comprised an open reading frame of 1, 341 bp encoding a protein of 446 amino acids that shares high similarity with the known plant ACSs. Using PCR amplification technique, a genomic clone (GenBank accession number: KC146402) corresponding to PpACS2 was isolated and shown to contain two introns. The PpACS2 gene product shared 97% identity with an ACC synthase from pear (Pyrus communis). Phylogenetic analyses clearly placed the gene product in the ACC synthase cluster of plant ACS superfamily tree. Quantitative RT-PCR analysis indicated that the PpACS2 gene was preferentially expressed in young pear leaves and shoots. The transcript of PpACS2 gene was accumulated at relatively high levels in anthers, but no signal was detected in the petals and mesocarp of pear. These results suggest that the PpACS2 may participate in the regulation of ethylene production in pear leaves, shoots, and anthers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».