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Enregistrement W2176734385 · doi:10.1016/j.jcmgh.2015.11.001

New and Unexpected Biological Functions for the Src-Homology 2 Domain-Containing Phosphatase SHP-2 in the Gastrointestinal Tract

2015· review· en· W2176734385 sur OpenAlexaff
Geneviève Coulombe, Nathalie Rivard

Notice bibliographique

RevueCellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology · 2015
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancer researchBiologyProto-oncogene tyrosine-protein kinase SrcProtein kinase BWnt signaling pathwayProtein tyrosine phosphataseReceptor tyrosine kinaseTyrosine kinaseCell biologySignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SHP-2 is a tyrosine phosphatase widely expressed and involved in multiple cell signaling processes.Accumulating evidence now is emerging whereby dysfunction in this protein tyrosine phosphatase also represents a key factor in the pathogenesis of gastrointestinal diseases, in particular in chronic inflammation and cancer.SHP-2 is a tyrosine phosphatase expressed in most embryonic and adult tissues.SHP-2 regulates many cellular functions including growth, differentiation, migration, and survival.Genetic and biochemical evidence show that SHP-2 is required for rat sarcoma viral oncogene/extracellular signal-regulated kinases mitogen-activated protein kinase pathway activation by most tyrosine kinase receptors, as well as by G-protein-coupled and cytokine receptors.In addition, SHP-2 can regulate the Janus kinase/signal transducers and activators of transcription, nuclear factor-kB, phosphatidyl-inositol 3-kinase/Akt, RhoA, Hippo, and Wnt/ b-catenin signaling pathways.Emerging evidence has shown that SHP-2 dysfunction represents a key factor in the pathogenesis of gastrointestinal diseases, in particular in chronic inflammation and cancer.Variations within the gene locus encoding SHP-2 have been associated with increased susceptibility to develop ulcerative colitis and gastric atrophy.Furthermore, mice with conditional deletion of SHP-2 in intestinal epithelial cells rapidly develop severe colitis.Similarly, hepatocyte-specific deletion of SHP-2 induces hepatic inflammation, resulting in regenerative hyperplasia and development of tumors in aged mice.However, the SHP-2 gene initially was suggested to be a proto-oncogene because activating mutations of this gene were found in pediatric leukemias and certain forms of liver and colon cancers.Moreover, SHP-2 expression is up-regulated in gastric and hepatocellular cancers.Notably, SHP-2 functions downstream of cytotoxin-associated antigen A (CagA), the major virulence factor of Helicobacter pylori, and is associated with increased risks of gastric cancer.Further compounding this complexity, most recent findings suggest that SHP-2 also coordinates carbohydrate, lipid, and bile acid synthesis in the liver and pancreas.This review aims to summarize current knowledge and recent data regarding the biological functions of SHP-2 in the gastrointestinal tract.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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