MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2177087620 · doi:10.1111/j.1550-7408.2002.tb00336.x

Re‐examining Alveolate Evolution Using Multiple Protein Molecular Phylogenies

2002· article· en· W2177087620 sur OpenAlex
Naomi M. Fast, Lingru Xue, Scott E. Bingham, Patrick J. Keeling

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Eukaryotic Microbiology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtist diversity and phylogeny
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaCanadian Institute for Advanced Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyDinoflagellateApicomplexaPhylogenetic treePhylogeneticsProtozoaProtistGeneMolecular phylogeneticsEvolutionary biologyRibosomal RNAGeneticsEcologyProtozoal disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alveolates are a diverse group of protists that includes three major lineages: ciliates, apicomplexa, and dinoflagellates. Among these three, it is thought that the apicomplexa and dinoflagellates are more closely related to one another than to ciliates. However, this conclusion is based almost entirely on results from ribosomal RNA phylogeny because very few morphological characters address this issue and scant molecular data are available from dinoflagellates. To better examine the relationships between the three major alveolate groups, we have sequenced six genes from the non-photosynthetic dinoflagellate, Crypthecodinium cohnii: actin, beta-tubulin, hsp70, BiP, hsp90, and mitochondrial hsp10. Beta-tubulin, hsp70, BiP, and hsp90 were found to be useful for intra-alveolate phylogeny, and trees were inferred from these genes individually and in combination. Trees inferred from individual genes generally supported the apicomplexa-dinoflagellate grouping, as did a combined analysis of all four genes. However, it was also found that the outgroup had a significant effect on the topology within alveolates when using certain methods of phylogenetic reconstruction, and an alternative topology clustering dinoflagellates and ciliates could not be rejected by the combined data. Altogether, these results support the sisterhood of apicomplexa and dinoflagellates, but point out that the relationship is not as strong as is often assumed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,676

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle