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Gene Expression Responses in Lymphoblastoid Cells after Radiation Exposure

2001· article· en· W2177283080 sur OpenAlexafffund
B. Ford, D. Wilkinson, Erika Thorleifson, B. L. Tracy

Notice bibliographique

RevueRadiation Research · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEffects of Radiation Exposure
Établissements canadiensHealth Canada
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyGene expressionGeneDNA microarrayGeneticsLymphoblastAlleleGene expression profilingMicroarrayPhenotypeCell culture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Individual differences in response to radiation are well known, but the molecular basis for these differences is not well understood, and molecular indicators that are useful in assessing individual variation are lacking. Cells from patients developing unexpected radiation responses have occasionally been analyzed for rare genetic anomalies (such as alleles of the ATM gene), but few data exist on the long-term effects of genetic variation on radiation response. We hypothesize that much of the variation in the response to radiation is due to differences in the genes that respond to radiation exposure, and that changes in gene expression may serve as surrogate markers of individual response. As a first step in developing a selection of suitable markers of gene expression, we used cDNA microarrays to identify genes that were altered in expression in lymphoblastoid cells 4 h after exposure to 1 Gy X rays. We found changes in gene expression ranging from a 10-fold repression to a 12-fold induction. Some of the responsive genes have been noted previously in other cell types, whereas others are reported for the first time. Using these data, we are beginning to characterize the range of structural, temporal and functional variations in the responsive genes. The results of this work will assist in developing response markers both for prescreening for sensitive individuals and for risk assessment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,216
Score d'incertitude au seuil0,817

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2001
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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