Overnight Lysis Improves the Efficiency of Detection of DNA Damage in the Alkaline Comet Assay
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
The ability to detect DNA damage using the alkaline comet assay depends on pH, lysis time and temperature during lysis. However, it is not known whether different lysis conditions identify different types of DNA damage or simply measure the same damage with different efficiencies. Results support the latter interpretation for radiation, but not for the alkylating agent MNNG. For X-ray-induced damage, cells showed the same amount of damage, regardless of lysis pH (12.3 compared to >13). However, increasing the duration of lysis at 5 degrees C from 1 h to more than 6 h increased the amount of DNA damage detected by almost twofold. Another twofold increase in apparent damage was observed by conducting lysis at room temperature (22 degrees C) for 6 h, but at the expense of a higher background level of DNA damage. The oxygen enhancement ratio and the rate of rejoining of single-strand breaks after irradiation were similar regardless of pH and lysis time, consistent with more efficient detection of strand breaks rather than detection of damage to the DNA bases. Conversely, after MNNG treatment, DNA damage was dependent on both lysis time and pH. With the higher-pH lysis, there was a reduction in the ratio of oxidative base damage to strand breaks as revealed using treatment with endonuclease III and formamidopyrimidine glycosylase. Therefore, our current results support the hypothesis that the increased sensitivity of longer lysis at higher pH for detecting radiation-induced DNA damage is due primarily to an increase in efficiency for detecting strand breaks, probably by allowing more time for DNA unwinding and diffusion before electrophoresis.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle