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Enregistrement W2177925390 · doi:10.1371/journal.pone.0142179

The Epidemiology of Invasive Haemophilus influenzae Non-Serotype B Disease in Ontario, Canada from 2004 to 2013

2015· article· en· W2177925390 sur OpenAlexaffabout
Shalini Desai, Frances Jamieson, Samir N. Patel, Chi Yon Seo, Vica Dang, J Fediurek, Debeka Navaranjan, Shelley L. Deeks

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBacterial Infections and Vaccines
Établissements canadiensToronto Public HealthUniversity of TorontoPublic Health Ontario
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpidemiologyIncidence (geometry)Haemophilus influenzaeMedicineSerotypePoisson regressionPopulationDisease surveillanceDiseasePediatricsDemographyInternal medicineEnvironmental healthImmunologyBiologyAntibioticsMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Since the widespread use of Haemophilus influenzae (Hi) type b (Hib) vaccines among children aged <5 years, an increase in invasive non-Hib disease incidence has been reported internationally. We sought to describe the epidemiology of invasive non-Hib disease in Ontario, Canada (population ~13.5 million). METHODS: Confirmed invasive non-Hib cases (non-typeable [NTHi] and serotypes a, c, d, e, and f) were obtained from the provincial laboratory data system from 2004-2013. Data were deterministically linked to the provincial reportable disease system to provide further case information. Antibiotic resistance data were analysed separately from 2010-2014. Descriptive analyses included incidence rates, age group, serotype, site of specimen collection and resistance patterns; ethnicity data were not available. Temporal trends were evaluated by Poisson regression and p-values <0.05 were considered significant. RESULTS: A total of 1307 cases of invasive non-Hib disease were included, increasing from 0.67 cases to 1.60 cases /100,000 from 2004 to 2013. Significant increases in the incidence of NTHi (0.50 to 1.28 cases/100 000 population), Hia (0.02 to 0.08 cases/100, 000) and Hif (0.13 to 0.18 cases/100, 000 population) were seen. Among persons aged 40-64 years, 3 Hi strains significantly increased over time; NTHi (0.22 to 0.99 cases/100, 000), Hia (0.00 to 0.06 cases/100, 000) and Hif (0.05 to 0.21 cases/100, 000). Among persons aged 65-84 years, there was a significant increase of NTHi (1.62 to 3.14 cases/100, 000) and Hia (0.00 to 0.34 cases/100, 000). Among persons aged 85+ years, only NTHi significantly increased from 4.89 to 10.28 cases/100, 000). Antimicrobial resistance (AMR) to ampicillin and clarithromycin was seen in greater than 25% of isolates but AMR did not increase over the duration of this study. CONCLUSIONS: The incidence of invasive non-Hib disease has increased over time; NTHi, Hif and Hia are emerging pathogens, and should be monitored.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,073
Score d'incertitude au seuil0,529

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0030,007
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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