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Enregistrement W2178785373 · doi:10.1371/journal.pone.0131230

Phylogeography of the Coastal Mosquito Aedes togoi across Climatic Zones: Testing an Anthropogenic Dispersal Hypothesis

2015· article· en· W2178785373 sur OpenAlexaffabout
Teiji Sota, Peter Belton, Michelle Tseng, Hoi Sen Yong, Motoyoshi Mogi

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaSimon Fraser University
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of Science
Mots-clésPhylogeographyBiologyBiological dispersalSubarctic climateEcologyHaplotypePopulationLand bridgeBeringiaSubtropicsGene flowTemperate climatePopulation geneticsZoologyGenetic variationPhylogeneticsGeneticsArcticGeneAlleleDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The coastal mosquito Aedes togoi occurs more or less continuously from subarctic to subtropic zones along the coasts of the Japanese islands and the East Asian mainland. It occurs also in tropical Southeast Asia and the North American Pacific coast, and the populations there are thought to have been introduced from Japan by ship. To test this hypothesis, the genetic divergence among geographic populations of A. togoi was studied using one mitochondrial and three nuclear gene sequences. We detected 71 mitochondrial haplotypes forming four lineages, with high nucleotide diversity around temperate Japan and declining towards peripheral ranges. The major lineage (L1) comprised 57 haplotypes from temperate and subarctic zones in Japan and Southeast Asia including southern China and Taiwan. Two other lineages were found from subtropical islands (L3) and a subarctic area (L4) of Japan. The Canadian population showed one unique haplotype (L2) diverged from the other lineages. In the combined nuclear gene tree, individuals with mitochondrial L4 haplotypes diverged from those with the other mitochondrial haplotypes L1-L3; although individuals with L1-L3 haplotypes showed shallow divergences in the nuclear gene sequences, individuals from Southeast Asia and Canada each formed a monophyletic group. Overall, the genetic composition of the Southeast Asian populations was closely related to that of temperate Japanese populations, suggesting recent gene flow between these regions. The Canadian population might have originated from anthropogenic introduction from somewhere in Asia, but the possibility that it could have spread across the Beringian land bridge cannot be ruled out.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,042

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,111
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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